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公开(公告)号：CN114067915A
公开(公告)日：2022-02-18
申请号：CN202111388132.2
申请日：2021-11-22
Applicant: 湖南大学
Abstract: 本发明涉及生物信息学中的数据挖掘，特别是涉及对单细胞RNA测序数据的挖掘。具体涉及通过深度学习的方法对单细胞RNA测序数据进行维度压缩以及聚类，来达到有效识别细胞种群的目的。本发明的方法包括对scRNA‑seq数据进行收集和预处理；构建深度对抗变分自编码器模型；使用构建的模型对预处理过的数据进行降维；将深度对抗变分自编码器与Bhattacharyya距离结合；对降维后的结果进行聚类分析。我们的模型约束了数据结构，并通过深度对抗变分自编码器模块进行降维。以标准化互信息这一评价指标为依据，在三个真实的scRNA‑seq数据集上进行的实验表明，本方法具有不错的性能。
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