一种鉴定区分多种真菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN118497392A

    公开(公告)日:2024-08-16

    申请号:CN202410007048.9

    申请日:2024-01-03

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本发明公开了一种鉴定区分多种真菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在4种真菌基因组上分别筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑12的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.24所示。所述引物对组合是设计的可在一次反应中扩增所述MNP标记的多重PCR扩增引物;所述试剂盒综合多重PCR扩增和二代测序技术,在一次测序反应对多样本中的4种真菌进行鉴定和区分,在真菌的防疫监测,科研和变异监测等应用中,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准、免培养的技术优势。

    一种准确检测玉米转基因成分的引物组、试剂盒及方法

    公开(公告)号:CN114507749B

    公开(公告)日:2024-07-05

    申请号:CN202210194920.6

    申请日:2022-02-28

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本申请涉及生物技术领域,尤其涉及一种准确检测玉米转基因成分的引物组、试剂盒及方法;所述引物组包括36对检测引物对,36对检测引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.72所示;2对扩增引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.73~SEQ ID NO.76所示;所述试剂盒包括引物组;所述方法包括:分别得到核苷酸序列;根据核苷酸序列,分别设计出引物组;提取待检样品的基因组DNA,得到待测玉米转基因成分的基因组DNA;以基因组DNA为模板,以引物组为扩增体系进行扩增反应,得到扩增产物;将扩增产物进行高通量测序,得到高通量测序数据;将高通量进行基因分析,确定待测玉米样品中是否含有转基因成分;通过设计出的引物组,能够实现在同一PCR反应中实现多个靶标分子的同时检测。

    一种用于鉴定大豆品种的引物组、试剂盒及鉴定方法

    公开(公告)号:CN117757979A

    公开(公告)日:2024-03-26

    申请号:CN202311815523.7

    申请日:2023-12-27

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本公开提供了一种用于鉴定大豆品种的引物组、试剂盒及鉴定方法。引物组包括:第1引物对至第507引物对,每个引物对均包括正向引物和反向引物,第1引物对的正向引物、第1引物对的反向引物至第507引物对的正向引物和第507引物对的反向引物依次如序列表中SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:1014所示。利用该引物组可通过多重PCR扩增和高通量测序获得待测样本的DNA指纹数据,再通过比较待测样本间的DNA指纹数据得到品种鉴定结论,且准确率和数字化程度高,可通过序列分析软件一次性比对成百上千个待测样本,快速获得品种鉴定结论,能显著提高大豆品种鉴定的准确率和效率。

    一种基于高通量测序检测生物技术产品的方法及其应用

    公开(公告)号:CN117305427A

    公开(公告)日:2023-12-29

    申请号:CN202311365503.4

    申请日:2023-10-20

    IPC分类号: C12Q1/6869 C12Q1/6895

    摘要: 本发明公开一种基于高通量测序检测生物技术产品的方法及其应用。所述方法包括:设计与待测生物技术产品的目标基因具有高度特异性的探针的序列;提取待测生物技术产品的DNA样本;将所述DNA样本进行目标扩增,构建获得文库;后将所述探针与所述文库进行杂交,获得经探针捕获扩增的DNA片段并高通量测序,获得测序数据并高通量数据分析,获得待测生物技术产品的转基因特征序列信息或基因编辑位点信息。该方法通过一次高通量测序不仅可以获得转基因产品的特征序列信息,还可以获得基因编辑产品的基因编辑位点序列、编辑位点的基因型及其种类,编辑位点基因型的比例,基因编辑产品的脱靶位点的基因型、种类及比例,高效、灵敏且通量高。

    一种基于高通量测序和探针富集的鉴定转基因事件的方法

    公开(公告)号:CN113957130B

    公开(公告)日:2023-12-22

    申请号:CN202111133102.7

    申请日:2021-09-27

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本申请涉及生物信息学技术领域,尤其涉及一种基于高通量测序和探针富集的快速鉴定转基因事件的方法。所述方法包括以下步骤:得到目标生物体的靶外源基因序列、所述靶外源基因序列的捕获探针、若干待标识的DNA片段和参考基因组序列;得到含接头的所述DNA片段;使用所述捕获探针对所述含接头的DNA片段中的靶外源基因进行捕获与文库构建,得到富集文库;对所述富集文库进行高通量测序,得到高通量测序数据;用所述高通量测序数据中的DNA序列分别与所述参考基因组序列和所述靶外源基因进行比对,确定所述靶外源基因插入所述目标生物体基因组上的位置。本方法无需全基因组测序,大大节省了成本,而且可用于转入外源基因或者载体不清楚的转基因材料。

    用于小麦品种鉴定的MNP标记位点、引物组合物和试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN113817859B

    公开(公告)日:2023-10-13

    申请号:CN202110977755.7

    申请日:2021-08-24

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本发明公开了一种用于小麦品种鉴定的MNP标记位点、引物组合物和试剂盒及其应用,所述MNP标记位点为在小麦基因组上筛选的在小麦种群内具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括小麦基因组iwgsc_refseqv1.0上MNP‑1~MNP‑735的标记位点。所述引物如SEQID NO.1~SEQ ID NO.1470所示。所述MNP标记位点数目多、多态性高、品种区分能力强,满足小麦品种真实性鉴定和实质性派生品种鉴定需求;所述引物互不干扰,鉴定准确度高、结果重现性强,满足DNA指纹数据库构建的要求;可应用于大规模小麦品种鉴定,在农作物产品的市场监管、知识产权保护、新品种培育等方面具有极大的应用价值。