公开(公告)号：CN116646010B

公开(公告)日：2024-03-29

申请号：CN202310930697.1

申请日：2023-07-27

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 夏慧华 ,  杨悦 ,  王谷丰 ,  刘二凯 ,  赵陆洋

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G06F18/214 ,  G06F18/23 ,  G06F18/2411

Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域，公开了一种人源性病毒检测方法及装置、设备、存储介质，通过对多个目标基因序列进行聚类分类获得多个聚类类别，将每个聚类类别中的代表性序列与人源性病毒对应的目标扩增子序列进行比对，获得比对结果，然后根据比对结果计算比对上目标扩增子序列的目标指标值、覆盖度和平均覆盖深度，输入分类模型进行预测获得分类结果，该分类结果用于表征从基因测序数据中是否检测到人源性病毒，从而无需将目标基因序列逐个与目标扩增子序列进行比对，可以大大降低比对耗时，进而提高检测效率。

公开(公告)号：CN116646010A

公开(公告)日：2023-08-25

申请号：CN202310930697.1

申请日：2023-07-27

Applicant: 深圳赛陆医疗科技有限公司

Inventor： 夏慧华 ,  杨悦 ,  王谷丰 ,  刘二凯 ,  赵陆洋

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G06F18/214 ,  G06F18/23 ,  G06F18/2411

Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域，公开了一种人源性病毒检测方法及装置、设备、存储介质，通过对多个目标基因序列进行聚类分类获得多个聚类类别，将每个聚类类别中的代表性序列与人源性病毒对应的目标扩增子序列进行比对，获得比对结果，然后根据比对结果计算比对上目标扩增子序列的目标指标值、覆盖度和平均覆盖深度，输入分类模型进行预测获得分类结果，该分类结果用于表征从基因测序数据中是否检测到人源性病毒，从而无需将目标基因序列逐个与目标扩增子序列进行比对，可以大大降低比对耗时，进而提高检测效率。