确定探针集的方法、试剂盒及其用途

    公开(公告)号:CN105787294B

    公开(公告)日:2018-09-14

    申请号:CN201410817092.2

    申请日:2014-12-24

    IPC分类号: G06F19/20 C12Q1/68

    摘要: 本发明公开一种确定探针集的方法,所述探针集包含多个探针,所述方法包括:获取DNA序列集,所述DNA序列集包含多条长度为K0的DNA序列,获取所述DNA序列集包括,从长度为L的参考序列的一端的第i个核苷酸开始,沿另一端方向拷贝所述参考序列的K0个连续核苷酸为一条DNA序列,i依次取{1,2,…,(L‑K0),(L‑K0+1)}中的数值;筛选所述DNA序列集,以获得所述探针,其中包括,过滤掉与所述参考序列的匹配位置个数大于2的DNA序列;其中,200nt≥K0≥50nt。本发明还公开一种试剂盒、该试剂盒的用途以及一种确定物种丰度的方法。