-
公开(公告)号：CN107058525A
公开(公告)日：2017-08-18
申请号：CN201710169145.8
申请日：2017-03-21
Applicant: 济南大学
Abstract: 本发明属于植物分子生物技术和基因工程领域，具体涉及一种基于基因表达量与性状动态相关性预测玉米未知基因功能的方法，该方法是通过以下步骤实现的：首先收集玉米自交系授粉后15天的籽粒转录本测序获得基因表达量数据；建立动态关联分析LA模型；LA显著性评估；挖掘玉米全基因组基因共表达模式的动态关联；对显著LA结果的基因进行功能注释，预测未知基因的功能。本发明以玉米籽粒中基因对共表达模式动态关联这一现象为突破口，预测未知基因功能。相比较于传统的共表达网络构建，动态关联分析可以快速找到调控共表达模式的调控基因。
-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106929579A
公开(公告)日：2017-07-07
申请号：CN201710169264.3
申请日：2017-03-21
Applicant: 济南大学
Abstract: 本发明属于植物分子生物技术和基因工程领域，具体涉及一种基于动态关联分析挖掘玉米籽粒油脂代谢机制的方法，具体如下：收集玉米自交系基因表达量数据；收集与玉米籽粒含油量相关联的基因数据；收集玉米自交系组成的关联群体的籽粒含油量数据；动态关联分析LA模型的建立；全基因组范围内挖掘调控26个含油量关联基因共表达模式动态变化的调控基因及鉴定与26个含油量关联基因共表达模式动态关联的候选基因；对候选基因进行功能注释；检测候选基因是否落在油份性状的QTL区间内；与玉米自交系的油份表型数据进行区段关联分析。本发明以调控已知的油份关联基因共表达模式动态关联为突破口，可快速有效的鉴定调控籽粒油脂代谢的调控基因。
-
公开(公告)号：CN106929579B
公开(公告)日：2020-10-27
申请号：CN201710169264.3
申请日：2017-03-21
Applicant: 济南大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6895 , G16B40/00 , G16B25/10
Abstract: 本发明属于植物分子生物技术和基因工程领域，具体涉及一种基于动态关联分析挖掘玉米籽粒油脂代谢机制的方法，具体如下：收集玉米自交系基因表达量数据；收集与玉米籽粒含油量相关联的基因数据；收集玉米自交系组成的关联群体的籽粒含油量数据；动态关联分析LA模型的建立；全基因组范围内挖掘调控26个含油量关联基因共表达模式动态变化的的调控基因及鉴定与26个含油量关联基因共表达模式动态关联的候选基因；对候选基因进行功能注释；检测候选基因是否落在油份性状的QTL区间内；与玉米自交系的油份表型数据进行区段关联分析。本发明以调控已知的油份关联基因共表达模式动态关联为突破口，可快速有效的鉴定调控籽粒油脂代谢的调控基因。
-
公开(公告)号：CN107058526A
公开(公告)日：2017-08-18
申请号：CN201710169156.6
申请日：2017-03-21
Applicant: 济南大学
Abstract: 本发明属于功能基因组学领域，具体涉及一种基于基因对共表达模式动态关联解析玉米籽粒类胡萝卜代谢调控机制的方法，该方法是通过以下步骤实现的：通过玉米基因组数据库maizeGDB下载类胡萝卜素代谢通路中的关键基因13个；收集玉米自交系授粉后15天的籽粒转录本测序获得基因表达量数据，提取上述13个关键基因的表达量数据；动态关联分析LA模型的建立；利用动态关联分析鉴定通路中关键基因之间的调控关系。本发明基于动态关联分析,挖掘类胡萝卜素代谢途径中的13个关键基因的调控关系，解析籽粒类胡萝卜合成和累积的调控机制，为分子标记辅助育种提供最佳的基因组合,对提高玉米中胡萝卜素以及改善玉米品质有重要的意义。
-
公开(公告)号：CN107058526B
公开(公告)日：2020-12-29
申请号：CN201710169156.6
申请日：2017-03-21
Applicant: 济南大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6895 , G16B20/00
Abstract: 本发明属于功能基因组学领域，具体涉及一种基于基因对共表达模式动态关联解析玉米籽粒类胡萝卜代谢调控机制的方法，该方法是通过以下步骤实现的：通过玉米基因组数据库maizeGDB下载类胡萝卜素代谢通路中的关键基因13个；收集玉米自交系授粉后15天的籽粒转录本测序获得基因表达量数据，提取上述13个关键基因的表达量数据；动态关联分析LA模型的建立；利用动态关联分析鉴定通路中关键基因之间的调控关系。本发明基于动态关联分析,挖掘类胡萝卜素代谢途径中的13个关键基因的调控关系，解析籽粒类胡萝卜合成和累积的调控机制，为分子标记辅助育种提供最佳的基因组合,对提高玉米中胡萝卜素以及改善玉米品质有重要的意义。
-
公开(公告)号：CN107058525B
公开(公告)日：2020-12-29
申请号：CN201710169145.8
申请日：2017-03-21
Applicant: 济南大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6895 , G16B25/00
Abstract: 本发明属于植物分子生物技术和基因工程领域，具体涉及一种基于基因表达量与性状动态相关性预测玉米未知基因功能的方法，该方法是通过以下步骤实现的：首先收集玉米自交系授粉后15天的籽粒转录本测序获得基因表达量数据；建立动态关联分析LA模型；LA显著性评估；挖掘玉米全基因组基因共表达模式的动态关联；对显著LA结果的基因进行功能注释，预测未知基因的功能。本发明以玉米籽粒中基因对共表达模式动态关联这一现象为突破口，预测未知基因功能。相比较于传统的共表达网络构建，动态关联分析可以快速找到调控共表达模式的调控基因。
-
-
-
-
-
Search Results
6
records
(took 0.012 seconds)
