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公开(公告)号：CN1668921A
公开(公告)日：2005-09-14
申请号：CN03816315.2
申请日：2003-07-03
Applicant: 法米克斯公司
Inventor： 福雷斯特·H·Ⅲ·贝内特 , 威廉·麦德罗威克
CPC classification number: G06F19/709 , G06F19/701
Abstract: 本发明是关于一种分子系统的分子力学分析的方法及装置，其具有可重新配置的特殊用途的硬件，用于分析分子系统。本发明提供一种加速器，其用于执行分子系统的分子力学计算，其包括：存储器，用于存储分子系统拓扑数据和分子系统原子数据，分子系统原子数据包括原子类型、点电荷、以及分子系统中每一个原子的三维坐标；处理器，其连接于存储器，处理器是一个单片集成电路，其具有被编程的可编程逻辑计算至少一个局部相互作用项和计算非键合相互作用项。在一个可编程逻辑设备集成电路上进行全部的分子力学计算。该单片集成电路加速器通过执行运行时PLD重新编程来处理分子力学计算中的不同的项。
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