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公开(公告)号：CN116445588A
公开(公告)日：2023-07-18
申请号：CN202310335680.1
申请日：2023-03-28
Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888 , C12Q1/70 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了用于病原微生物快速检测的定量参考品和检测方法，本发明提供的定量参考品的序列与任意物种的核酸序列均不重叠，并基于该定量参考品提供了一种病原微生物快速检测方法。本发明通过引入定量参考品，在建库阶段即可通过样本浓度和毛细管电泳结果直观判断建库是否成功，极大缩短了失败样本判断时间与成本，进而缩短实验周期；而且本发明方法可用于检测含有人源基因组DNA的核酸样本，不仅检出限低，且可实现大量不同类型病原微生物的同时检出，检测时间也可缩短至4‑6h，对病原微生物的快速即时检测具有重要意义。
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公开(公告)号：CN116218955A
公开(公告)日：2023-06-06
申请号：CN202310324961.7
申请日：2023-03-29
Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了用于病原微生物检测的超多重PCR建库试剂盒和检测方法，本发明通过限定试剂盒中引物3’末端的碱基组成来降低多重引物的复杂性与引物间可结合后的延伸性，以避免引物数量过高引起的非特异性扩增，并通过限制位于引物5’端的通用序列结构，有效解决了多重扩增中易出现引物二聚体或多聚体、多重扩增引物干扰、扩增效率差、扩增偏好大与中靶产物比例低的问题；通过上述试剂盒进行病原微生物检测不仅提高了建库质量，而且有效缩短检测时间，对病原微生物的快速即时检测具有重要意义。
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公开(公告)号：CN118910330A
公开(公告)日：2024-11-08
申请号：CN202411086453.0
申请日：2024-08-08
Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了一种基于三代靶向测序检测RNA病毒的组合物、试剂盒及其应用，属于生物检测技术领域。本发明中的检测包括如下步骤：S1、提取RNA病毒核酸后，进行逆转录，得到cDNA；S2、使用上述组合物对cDNA进行扩增，得到扩增产物，扩增产物经处理后，建库，得到混合文库；S3、将混合文库中的扩增产物连接接头序列，得到待测样品；S4、对待测样品进行测序，并分析检测结果。本发明能同时扩增75种病原微生物，然后采用三代靶向测序，能快速准确地对上述75种病原微生物进行区分鉴定。
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公开(公告)号：CN114842909A
公开(公告)日：2022-08-02
申请号：CN202210366295.9
申请日：2022-04-08
Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明属于病原微生物检测技术领域，公开了基于三代靶向测序数据的多靶标病原微生物分析方法，具体为：建立多靶标关联的纠错参考序列库，对原始测序数据质控，然后比对到病原微生物鉴定数据库，得到初步的微生物检出清单，基于清单和纠错参考序列库构建病原微生物检出库，将质控后的测序数据重新比对至病原微生物检出库得到准确的微生物检出清单。该方法能有效解决单靶标鉴定的准确性问题，实现待测样本中物种组成的精确检出，提升了数据分析的准确性与灵敏度。
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公开(公告)号：CN118588165A
公开(公告)日：2024-09-03
申请号：CN202410731333.5
申请日：2024-06-06
Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC: G16B25/20
Abstract: 本发明公开了一种基于kmers的物种特异性引物对设计方法及系统，该方法包括如下步骤：筛选并获取目标病原微生物多个基因组文件；利用基因组文件生成kmers序列集合，同时基于TM值和各集合间的比对获取保守kmers；将保守kmers比对至NCBI NT库，根据比对结果生成候选引物对；对候选引物对进行去冗余处理，得到物种特异性引物对。本发明方法适用广泛，且获取的物种特异性引物对的检测精度更高，可以大大减少测序量并提高检测准确性，为开发多重病原微生物PCR检测体系提供了一种新策略。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117877579A
公开(公告)日：2024-04-12
申请号：CN202311784402.0
申请日：2023-12-21
Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明公开了一种用于Nanopore靶向测序的嵌合体过滤方法，具体为：基于各病原微生物基因组上靶向区域设计的引物进行多重扩增，扩增后使用Nanopore平台建库试剂盒进行建库并上机测序，将测序结果比对至针对病原微生物靶向区域构建的索引文件上，并对比对后的文件进行特定的过滤处理，根据过滤后测序结果比对至靶向区域的reads数，获得病原微生物的检出情况。通过本发明方法，可以有效减少测序结果中嵌合体等数据的干扰，从而提升病原微生物检出的准确性。
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公开(公告)号：CN114613440A
公开(公告)日：2022-06-10
申请号：CN202210320620.8
申请日：2022-03-29
Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明属于病原微生物检测技术领域，公开了一种基于长读长测序数据的病原微生物分析方法，具体包括：建立纠错参考序列库，将质控后的测序数据比对至纠错参考序列库校正，并在校正后合并相似度高的序列，再比对至病原微生物鉴定数据库得到微生物检出清单。本发明通过对测序数据的校正和合并，有效提高了数据分析速度，并有效降低了长度长测序数据结果的假阳性，实现病原微生物的快速、准确检出。
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公开(公告)号：CN116189774A
公开(公告)日：2023-05-30
申请号：CN202310319074.0
申请日：2023-03-29
Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司
IPC: G16B30/00 , C12Q1/6869 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种基于基因组序列的超多重PCR阳性评估方法，该方法包括以下步骤：截取每个物种基因组上与其靶区域对应的区段，建立区段与物种的对应关系，并构建索引；将多重PCR的测序结果比对至索引上，获取比对至每个区段的reads数；根据每个物种设计的靶区域数和实际检出的靶标数目引入置信度计算公式，并根据每个物种的置信度确认是否为真实阳性检出。本发明通过引入特定的置信度计算公式，可有效消除测序结果中由非特异性扩增、或引物保守度不高等因素导致的假阳性，提高检测准确性。
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公开(公告)号：CN115851891A
公开(公告)日：2023-03-28
申请号：CN202211506377.5
申请日：2022-11-29
Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明公开了一种超多重特异性PCR引物组设计方法和系统，所述方法包括病原微生物基因序列的获取、参考基因序列的筛选、基因序列的片段化、基因序列的比对、引物设计及优化等过程。通过本发明所述方法获得的引物组特异性高，检测灵敏度更优，检测精度更高，且可以实现对细菌、真菌、寄生虫、病毒和耐药基因的检测。
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公开(公告)号：CN115786548A
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202211198646.6
申请日：2022-09-29
Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明公开了用于病原微生物耐药基因检测的引物组、试剂盒及方法，所述引物组包括序列如SEQ ID NO.2n‑1所示的F端引物，以及与F端引物对应的R端引物序列如SEQ ID NO.2n所示，其中n的数值为1～17。本发明提供的引物组可以实现同时多达20种不同类型耐药基因的检测，且检测稳定性高，准确性高；使用该引物组和检测方法，在6‑8小时即可完成整个耐药基因检测过程，实现了病原微生物耐药基因的快速检测。
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