公开(公告)号：CN116913381A

公开(公告)日：2023-10-20

申请号：CN202310954432.5

申请日：2023-07-31

Applicant: 武汉大学中南医院

Inventor： 李翔 ,  刘泽晨 ,  张菲杨 ,  魏嵬 ,  陈劲草 ,  赵琼一 ,  亀井王丹 ,  侯圣群

IPC: G16B25/10 ,  G16B20/30 ,  G06F17/16

Abstract: 本发明提供一种基于单细胞组学的各亚群分子标记物的计算方法及系统。计算方法包括方法A和方法B中的一种或两种。方法A：(1)获取单细胞组学数据；(2)利用注释信息，计算平均表达矩阵；(3)对平均表达矩阵进行最大标准化计算；(4)将基因所在细胞类型亚群进行二分类；(5)过滤低表达基因，计算正、负分子指数以及分子指数；(6)根据基因的高表达组的数量、基础表达量和分子指数，进行综合排序；(7)使用热图和气泡图对分析结果进行可视化，同时提供计算过程中涉及的所有的中间运算指标，可视化得到结果。该方法明确提升了分子标志物的特异性，大幅提高计算效率，优化了传统分析方法的输出结果。