一种提高量子点基因芯片检测SNP特异性的方法

    公开(公告)号:CN118853841A

    公开(公告)日:2024-10-29

    申请号:CN202410914096.6

    申请日:2024-07-09

    IPC分类号: C12Q1/6858 C12Q1/6837

    摘要: 本发明提供一种提高量子点基因芯片检测SNP特异性的方法,该方法在芯片杂交的过程中加入特异性的探针进行竞争性杂交,具体方法为:将核酸扩增后的产物变性,并分为两部分;其中一部分与量子点基因芯片上固定的野生型探针以及游离的突变型探针进行竞争性杂交,另一部分与量子点基因芯片上固定的突变型探针以及游离的野生型探针进行竞争性杂交;杂交后洗去游离探针,对量子点基因芯片上固定探针的杂交产物进行检测从而确定样本中是否含有相关靶标核酸。本发明方法将非特异性的产物进行竞争性杂交结合后,保留特异性的杂交产物,即使探针特异性不佳,也可进一步提高检测SNP的特异性。

    一种提高基因甲基化检测灵敏度的方法

    公开(公告)号:CN118127134A

    公开(公告)日:2024-06-04

    申请号:CN202410428831.2

    申请日:2024-04-10

    IPC分类号: C12Q1/6851 C12N15/11

    摘要: 本发明公开一种提高基因甲基化检测灵敏度的方法,采用本发明方法进行甲基化位点检测时,扩增反应的上下游引物为常规引物;荧光检测探针为两条及以上,荧光检测探针为寡核苷酸单链DNA,在5'端带有荧光基团,3’端带有淬灭基团,且两条荧光检测探针的设计位点均在DNA的同一条链上,呈串联形式排列。本发明方法通过在常规荧光探针设计的基础上,在目的片段内和第一条探针的相同方向再增加一条荧光检测探针,能够涵盖更多的甲基化位点,提高了基因甲基化检测的灵敏度。

    一种用于相邻SNP检测的引物和探针及其设计方法

    公开(公告)号:CN116751843A

    公开(公告)日:2023-09-15

    申请号:CN202310741854.4

    申请日:2023-06-21

    IPC分类号: C12Q1/6811 C12N15/11

    摘要: 本发明提供一种用于相邻SNP检测的引物和探针及其设计方法,该方法中引物的设计方法为将两个位点设计在一个扩增子内,其中上游引物Fb和下游引物Rb的5’末端均采用生物素进行修饰,同时将第一个位点的野生型和突变型的捕获探针设计为正向,将第二个位点的野生型和突变型的捕获探针设计为反向;扩增产物变性后,两个位点的探针分别与相反方向带生物素的单链DNA杂交,避免了两个位点探针设计在同一条链上的竞争性杂交。本发明方法简单,把两个位点的竞争杂交改为独立杂交,能够有效提高相邻SNP检测的灵敏度。