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公开(公告)号：CN116875668A
公开(公告)日：2023-10-13
申请号：CN202310591310.4
申请日：2023-05-24
Applicant: 暨南大学附属第一医院(广州华侨医院) , 中国科学院大学深圳医院(光明)
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种捕获特定RNA结合蛋白介导的RNA‑RNA相互作用的方法，通过对细胞进行UV交联固定RNA结合蛋白和RNA的相互作用，裂解细胞之后，通过结合特异性抗体的磁珠将特定的RNA结合蛋白及其结合的RNA富集在磁珠上，将RNA酶切成片段，然后在RNA的3’末端进行pCp‑biotin标记并在磁珠上进行近端连接。将RNA结合蛋白‑RNA复合物从磁珠上洗脱，1/3的复合物用蛋白胶电泳并转移到硝酸纤维素膜上后，通过化学发光的方法进行检测，2/3的复合物在转移到硝酸纤维素膜上后，切下RNA结合蛋白‑RNA复合物，分离纯化RNA并构建链特异性文库进行测序。本发明使用化学发光法替代放射性元素检测蛋白‑RNA复合物，提高了安全性和方便性；无需过表达特定RNA结合蛋白，提高了嵌合体RNA的检出率。
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