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公开(公告)号:CN110189796A
公开(公告)日:2019-08-30
申请号:CN201910448101.8
申请日:2019-05-27
Applicant: 新疆农业大学
Abstract: 本发明公开了一种绵羊全基因组重测序分析方法,涉及基因技术领域。本发明方法包括以下步骤:(1)获取绵羊DNA,检测其纯度、浓度及体积,对检测合格后的样品进行文库制备和文库质检,对质检合格的文库进行测序,获得绵羊原始测序数据;(2)对所述绵羊原始测序数据进行数据过滤并评估测序质量,经数据质控合格后获得目标分析序列数据;(3)将所述目标分析序列数据比对到绵羊参考基因组上,经比对指标质控合格后获得比对上的数据;(4)检测所述比对上的数据的单核苷酸SNP变异、小片段插入缺失变异InDel及染色体结构变异SV,并进行注释,获得绵羊全基因组测序序列中的SNP数据信息、InDel数据信息和SV数据信息。
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公开(公告)号:CN110093406A
公开(公告)日:2019-08-06
申请号:CN201910447387.8
申请日:2019-05-27
Applicant: 新疆农业大学
IPC: C12Q1/6858 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种盘羊及其杂交后代遗传基因研究方法。包括:以亲本巴什拜羊、野生盘羊、杂交F1代、回交F2代个体作为研究对象;获取群体DNA,纯度、浓度及体积,文库制备和质检,测序,获得原始测序数据;进行数据过滤并评估测序质量,获得目标分析序列数据;将目标分析序列数据比对到巴什拜羊参考基因组上,获得比对上的数据;检测比对上的数据的SNP、InDel及SV,进行注释,获得家系群体全基因组中的SNP数据信息、InDel数据信息、SV数据信息;通过各数据信息分析家系群体个体遗传变异信息,推测和确定性状相关信息。通过本发明方法可清楚展示盘羊遗传相关基因,可为以后育种提供科学依据。
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