基于不确定蛋白质相互作用网络中关键蛋白质识别方法

    公开(公告)号:CN109686403A

    公开(公告)日:2019-04-26

    申请号:CN201811597473.9

    申请日:2018-12-26

    Applicant: 扬州大学

    Inventor: 刘维 马良玉 何杰

    CPC classification number: G06K9/6215 G06K9/6221

    Abstract: 基于不确定蛋白质相互作用网络中关键蛋白质识别方法使用SimRank来进行蛋白质相似度计算,通过将不确定网络中计算SimRank问题转换成在确定性网络的SimRank计算,之后,考虑了蛋白质相互作用网络的拓扑特性和蛋白质的生物特征,通过计算边缘聚类系数、基因本体相似度、皮尔逊相关系数、亚细胞定位分数,得出一个重要性分数。最终按分值由大到小排列,输出分值对应的前k个蛋白质即为最后结果。本发明在不确定相互作用网络上,融合生物属性和拓扑特性提高了识别关键蛋白质的准确性,同时使预测结果更加准确,提高了预测的效率,扩展了该技术在生物信息领域的应用范围和实用性。

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