公开(公告)号：CN119920311A

公开(公告)日：2025-05-02

申请号：CN202510120999.1

申请日：2025-01-24

Applicant: 广州国家实验室

Inventor： 钟雯 ,  纪代瀚 ,  韩梅

IPC: G16B25/00 ,  G16B40/00 ,  G06F18/2433 ,  G06F18/2135 ,  G06F18/232

Abstract: 本发明涉及一种单细胞数据质控处理的方法，包括如下步骤：步骤一)根据待处理的单细胞数据计算得到质控指标；然后根据所述质控指标和/或细胞类型组成识别待处理的单细胞数据中的离群点，得到样本层级质控分析结果；步骤二)识别待处理的单细胞数据中的空液滴以及双细胞数据；然后识别待处理的单细胞数据中的低质量细胞数据，得到细胞层级质控分析结果；步骤三)计算和评估待处理的单细胞数据中每个特征的平均表达水平、表达标准化方差和在所有细胞中的检出率，得到特征层级质控分析结果；步骤四)评估待处理的单细胞数据的批次效应，得到批次效应评估分析结果。与现有的其他流程工具相比，本发明单细胞多组学质量控制流程工具更完整以及更具灵活性和友好性，为单细胞多组学分析提供了最全面和强大的质量控制工作流程。

公开(公告)号：CN119917879A

公开(公告)日：2025-05-02

申请号：CN202510121135.1

申请日：2025-01-24

Applicant: 广州国家实验室

Inventor： 钟雯 ,  纪代瀚 ,  韩梅

IPC: G06F18/23 ,  G06F18/214 ,  G16B25/00 ,  G16B40/00 ,  G16B30/00

Abstract: 本发明提供了一种双细胞识别方法，包括如下步骤：步骤一)获取待进行双细胞识别的数据集，然后对待进行双细胞识别的数据集进行聚类分群，得到多个细胞群体；步骤二)根据所述待进行双细胞识别的数据集的细胞类型确定互斥蛋白对，然后在步骤一)中得到的细胞群体中利用循环迭代的COSG方法确定互斥蛋白对中每一个蛋白所相对应的表达阴性细胞群体和表达阳性细胞群体；步骤三)根据表达阴性细胞群体和表达阳性细胞群体中的数据，计算所述互斥蛋白对中每一个蛋白的阴阳性表达的分界阈值；步骤四)根据所述分界阈值识别所述待进行双细胞识别的数据集中的双细胞数据。本发明基于循环迭代的COSG方法的双细胞识别方法在阴阳性细胞群模块识别更为稳定更有效。