公开(公告)号：CN102884203B

公开(公告)日：2014-06-25

申请号：CN201080066436.0

申请日：2010-08-13

Applicant: 崇实大学校产学协力团

Inventor： 金尚洙

IPC: C12Q1/68 ,  G06F17/10 ,  G06F19/24

CPC classification number: G06F19/24 ,  G06F19/22 ,  G06K9/6234 ,  G06K9/6284

Abstract: 本发明涉及一种用于对查询序列的基因型与亚型进行分类的方法。更具体地，本发明针对一种用于对查询序列的基因型与亚型进行分类的方法，包括：(i)选择不同病毒的碱基序列作为参考序列，这些病毒的基因型或亚型是已知的，并且通过在所述参考序列的多重比对中计算序列之间的距离而获得一种距离矩阵；以及(ii)开发一种判别方程，该判别方程可以对这些参考序列进行分类，这是通过对通过该距离矩阵的多维定标对所述参考序列成簇而获得的聚簇执行判别分析而实现的，接着根据所述判别方程对一种查询序列的基因型与亚型进行分类。

公开(公告)号：CN102884203A

公开(公告)日：2013-01-16

申请号：CN201080066436.0

申请日：2010-08-13

Applicant: 崇实大学校产学协力团

Inventor： 金尚洙

IPC: C12Q1/68 ,  G06F17/10 ,  G06F19/24

CPC classification number: G06F19/24 ,  G06F19/22 ,  G06K9/6234 ,  G06K9/6284

Abstract: 本发明涉及一种用于对查询序列的基因型与亚型进行分类的方法。更具体地，本发明针对一种用于对查询序列的基因型与亚型进行分类的方法，包括：(i)选择不同病毒的碱基序列作为参考序列，这些病毒的基因型或亚型是已知的，并且通过在所述参考序列的多重比对中计算序列之间的距离而获得一种距离矩阵；以及(ii)开发一种判别方程，该判别方程可以对这些参考序列进行分类，这是通过对通过该距离矩阵的多维定标对所述参考序列成簇而获得的聚簇执行判别分析而实现的，接着根据所述判别方程对一种查询序列的基因型与亚型进行分类。