公开(公告)号：CN117238366A

公开(公告)日：2023-12-15

申请号：CN202311185012.1

申请日：2023-09-13

Applicant: 安徽农业大学

Inventor： 王港澳 ,  刘银博 ,  闫晓迪 ,  丁志杰 ,  李俊 ,  曾欣 ,  祝小雷

IPC: G16B20/20 ,  G16B30/00 ,  G16H50/50

Abstract: 本发明公开了一种基于异构图变换器计算疾病与RNA关联的方法，涉及疾病预测技术领域，包括：S1：数据集构建；S2：多视图相似性度量模块构建；S3：自编码器模块进行构建；S4：对异构图变换器模块进行优化；S5：构建内积解码器模块；该基于异构图变换器计算疾病与RNA关联的方法，通过基于异构图转换器的计算方法VRMHMD，预测miRNA‑疾病之间的关联，VRMHMD在多模式编码的基础上增加了一个随机自动编码过程，对两组数据进行编码，并通过两个不同的多层HGT网络提取编码，来自HGT每层的输出编码被连接作为最终编码，使用注意力机制来融合这两组编码，并执行矩阵乘法解码，以预测新的miRNA疾病敏感性关联矩阵。

公开(公告)号：CN116798514A

公开(公告)日：2023-09-22

申请号：CN202310720219.8

申请日：2023-06-18

Applicant: 安徽农业大学

Inventor： 闫晓迪 ,  王港澳 ,  曾欣 ,  任欣欣 ,  刘银博 ,  马之倩 ,  祝小雷

IPC: G16B20/30 ,  G16B40/20 ,  G16B40/30 ,  G06N3/045 ,  G06N3/047 ,  G06N3/048 ,  G06N3/088 ,  G06N3/096 ,  G06N3/0985 ,  G06F16/35 ,  G06F18/214 ,  G06F18/243 ,  G06F18/25

Abstract: 本发明公开了一种预测生物赖氨酸乙酰化位点的方法，涉及涉及生物学乙酰化研究领域，预先训练了一个用于Kace位点预测的领域特异性BERT模型，并对其进行了微调，以适应物种的特异性，预先训练好的BERT模型为表示蛋白质序列的内在信息提供了一个有效的工具，在web服务器上公开源码和数据集，利用BERT‑Kace模型预测位点，通过输入蛋白质序列来预测位点。解决了从蛋白质序列中提取的手工特征，基于经验可能不能表征蛋白质序列中所包含的所有生物信息，无法更好的挖掘序列中的生物信息的问题。