从动植物转录组数据中挖掘内生微生物组信息的方法

    公开(公告)号:CN113284556A

    公开(公告)日:2021-08-20

    申请号:CN202110569644.2

    申请日:2021-05-25

    Abstract: 本发明公开了从动植物转录组数据中挖掘内生微生物组信息的方法,步骤包括:(1)对宿主动植物转录组测序原始数据进行清理,以获得仅含高质量序列的转录组数据;(2)将所述转录组数据与宿主参考基因组进行比对,获得含有微生物序列的数据文件;(3)通过分析所述数据文件获得内生微生物的组成信息。本方法与利用扩增子分析或者动植物组织全基因组测序分析微生物组成信息相比,不但可以分析出各类微生物组成及含量信息,还得到以往的宿主动植物基因表达信息,节约实验研究成本。

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