一种基于深度学习和长读测序的SNP和INDEL检测方法

    公开(公告)号:CN119028431B

    公开(公告)日:2024-12-31

    申请号:CN202411514743.0

    申请日:2024-10-29

    Abstract: 本发明适用于生物信息学领域,具体是一种基于深度学习和长读测序的SNP和INDEL检测方法,包括:对待检测数据进行第一预处理,生成第一叠加图像,将第一叠加图像作为SNP检测模型的输入,输出得到SNP的VCF文件;对待检测数据进行第二预处理,生成第二叠加图像,将第二叠加图像作为INDEL检测模型的输入,输出得到INDEL的VCF文件;利用基于R语言的VcfR数据处理工具,对所得到的VCF文件中的数据进行变异检测和处理,得到基因组上的变异检测结果;使用IGV输出显示基因组上的变异检测结果。本发明使用了深度学习技术和长读测序技术,能够解决传统方法在灵活性与泛化能力、计算效率上的低性能,以及面对复杂问题时短读测序存在的无法检测区域的问题。

    一种基于深度学习和长读测序的SNP和INDEL检测方法

    公开(公告)号:CN119028431A

    公开(公告)日:2024-11-26

    申请号:CN202411514743.0

    申请日:2024-10-29

    Abstract: 本发明适用于生物信息学领域,具体是一种基于深度学习和长读测序的SNP和INDEL检测方法,包括:对待检测数据进行第一预处理,生成第一叠加图像,将第一叠加图像作为SNP检测模型的输入,输出得到SNP的VCF文件;对待检测数据进行第二预处理,生成第二叠加图像,将第二叠加图像作为INDEL检测模型的输入,输出得到INDEL的VCF文件;利用基于R语言的VcfR数据处理工具,对所得到的VCF文件中的数据进行变异检测和处理,得到基因组上的变异检测结果;使用IGV输出显示基因组上的变异检测结果。本发明使用了深度学习技术和长读测序技术,能够解决传统方法在灵活性与泛化能力、计算效率上的低性能,以及面对复杂问题时短读测序存在的无法检测区域的问题。

    一种自动灌溉的苗菜无土培养设备

    公开(公告)号:CN217694738U

    公开(公告)日:2022-11-01

    申请号:CN202221727148.1

    申请日:2022-07-06

    Abstract: 本实用新型公开了一种自动灌溉的苗菜无土培养设备,包括滑柱、培养皿和支撑座,所述支撑座滑动连接在滑柱的内部并延伸至滑柱的外部,所述培养皿活动放置在支撑座的表面,所述培养皿内插接有过滤网,所述培养皿的内部插接有密封板,所述密封板和过滤网固定连接,所述支撑座内设置有定位机构,所述定位机构包括连接杆、弹簧和插杆,所述插杆滑动连接在支撑座的内部并延伸至滑柱的内部,所述弹簧固定连接在支撑座的内部并和插杆固定连接,所述培养皿设置成空心结构,所述培养皿的表面开设有多个呈线性排列的圆孔,本实用新型采用上述技术方案,实现了随着苗菜的生长,进行调节培养皿之间的距离,从而不影响苗菜的生长空间。

    一种蔬菜快速育苗设备
    4.
    实用新型

    公开(公告)号:CN217608635U

    公开(公告)日:2022-10-21

    申请号:CN202221971355.1

    申请日:2022-07-28

    Abstract: 本实用新型提供一种蔬菜快速育苗设备,包括底座、呈圆周阵列垂直设于底座上端面上的四根支撑杆、以及设于四根支撑杆上并位于底座上方的培育机构,培育机构包括通过固定组件设于四根支撑杆上并位于底座上方的培育块、设于培育块下方的喷水组件、以及设于底座上并可拆卸与喷水组件连接的驱动组件,驱动组件驱动喷水组件在培育块下方进行移动;本实用新型可以便捷调节放置培育杯的培育块之间距离,便于对不同种类蔬菜进行育苗,且便于进行育苗浇水。

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