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公开(公告)号:CN114350826A
公开(公告)日:2022-04-15
申请号:CN202210069587.6
申请日:2022-01-21
Applicant: 宁夏医科大学总医院
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12R1/01
Abstract: 不同级别脑胶质瘤肠道菌群标志物及其应用。具体应用步骤为:1)提供受试者的新鲜粪便样本;2)对样本进行粪便DNA的提取,肠道菌群16S rRNA基因文库的构建,文库的高通量测序;3)采用肠道微生物的特异性识别试剂进行PCR扩增并测序获得测序数据;4)测序数据的分析方法包括对文库测序后得到的数据进行拼接,过滤除去引物和嵌合体序列,进行OTU聚类和物种注释,得到肠道菌群样本中的物种多样性和物种丰度;5)对步骤4)中得到的OTU采用随机森林算法进行分析;6)预测所述受试者是否为不同级别脑胶质瘤患者。本发明通过检测特定菌群的变化,可以实现脑胶质瘤的辅助诊断,使用本发明的微生物标志物进行诊断,操作简单、特异性高、敏感性强。