公开(公告)号：CN112382411B

公开(公告)日：2022-10-18

申请号：CN202011275141.6

申请日：2020-11-13

Applicant: 大连理工大学

Inventor： 金博 ,  候亚庆 ,  程世成 ,  张强

IPC: G16H70/40 ,  G06F16/901 ,  G06F16/951 ,  G06K9/62 ,  G06N3/04

Abstract: 本发明公开一种基于异质图的药物‑蛋白质靶向作用预测方法，包括：S1.通过获取来自Drugbank、SIDER等数据库的药物，靶点以及疾病等信息，与已有的公开数据集进行匹配整合，构建药物和靶点相关的异质图，并通过RDKit计算和基于成对的Smith‑waterman得分获得药物化学结构信息和蛋白质序列信息。S2.结合节点表示与图级表示之间的互信息以及子结构表示与图级表示之间的互信息，从异构信息中学习精确的和可解释的特征嵌入，提出了一个端到端的多视图自动编码器模型完成链路预测的任务。本发明对于药物重定向具有有益的科学指导作用，有利于发现潜在的药物‑蛋白质靶点有效链接，加快旧药新用的节奏。

公开(公告)号：CN112382411A

公开(公告)日：2021-02-19

申请号：CN202011275141.6

申请日：2020-11-13

Applicant: 大连理工大学

Inventor： 程世成 ,  金博 ,  张强 ,  侯亚庆

IPC: G16H70/40 ,  G06F16/901 ,  G06F16/951 ,  G06K9/62 ,  G06N3/04

Abstract: 本发明公开一种基于异质图的药物‑蛋白质靶向作用预测方法，包括：S1.通过获取来自Drugbank、SIDER等数据库的药物，靶点以及疾病等信息，与已有的公开数据集进行匹配整合，构建药物和靶点相关的异质图，并通过RDKit计算和基于成对的Smith‑waterman得分获得药物化学结构信息和蛋白质序列信息。S2.结合节点表示与图级表示之间的互信息以及子结构表示与图级表示之间的互信息，从异构信息中学习精确的和可解释的特征嵌入，提出了一个端到端的多视图自动编码器模型完成链路预测的任务。本发明对于药物重定向具有有益的科学指导作用，有利于发现潜在的药物‑蛋白质靶点有效链接，加快旧药新用的节奏。