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发明公开
一种基于肿瘤转录组学特征预测转录因子靶基因的系统审中-实审

公开(公告)号：CN114708914A

公开(公告)日：2022-07-05

申请号：CN202210213180.6

申请日：2022-03-04

Applicant: 复旦大学附属金山医院(上海市金山区眼病防治所、上海市金山区核化伤害应急救治中心)

Inventor： 许国雄 , 王繁晨

IPC: G16B35/20 , G16B40/00 , G16B50/00

Abstract: 本发明涉及一种基于肿瘤转录组学特征预测转录因子靶基因的系统，由4大模块组成：泛癌范围的转录组学相关性计算模块；启动子区序列获取模块；位置权重矩阵打分模块；转录因子靶基因筛选模块。其优点表现在：创新性地使用了泛癌水平的转录组学数据，利用其中存在的广泛大量基因表达调控网络扰动，实现了操作上简单且高效的转录因子靶基因预测目的；本系统通过引入位置权重矩阵(PWM)打分，可以获得准确性较高的转录因子靶基因预测结果；本系统中所采用的所有数据资料理论上皆可通过开放性公共数据库获取，这进一步地降低了研究人员在使用该系统时的实验工作量和技术、经费门槛。

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