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公开(公告)号：CN120082637A
公开(公告)日：2025-06-03
申请号：CN202510085568.6
申请日：2025-01-20
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明公开了一种mRNA快速构建方法及其应用。所述方法利用预先制备的双链DNA片段库、全长扩增引物和化学合成的寡核苷酸(目标蛋白引物)，在高保真DNA聚合酶的催化合成下实现无菌环境的快速组装合成，合成的线性双链DNA经过简单的纯化即可用于体外转录反应合成目标mRNA。这种快速的mRNA构建方法可以用于快速合成编码单个肿瘤抗原表位的肿瘤mRNA疫苗，进一步可混合形成mRNA疫苗库用于肿瘤治疗，大大缩短肿瘤疫苗的开发周期和成本。此外，本发明还基于此快速的mRNA构建方法开发了肿瘤患者新抗原的快速鉴定方法，相比利用抗原多肽文库鉴定抗原免疫原性，本方法可以大大降低成本和缩短鉴定时间。
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公开(公告)号：CN118262793A
公开(公告)日：2024-06-28
申请号：CN202410249253.6
申请日：2024-03-05
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明提供了一种高效选择多价肿瘤新抗原组合的系统，旨在输入多个肿瘤新抗原肽段序列，并从这些序列构成的随机组合肽段池中筛选出具有最优化蛋白序列的组合，该系统包含三个关键模块：库构建模块、最优路径选择模块和连接子添加模块，库构建模块负责生成一个包含输入肽段序列所有可能组合的库，并计算每种组合的潜在效用。最优路径选择模块进一步负责从这些组合中筛选出最佳的蛋白序列组合，确保肽段之间的关联既准确又多样化。该模块通过精确筛选，挑选出能以最少的连接子生成、避免产生非预期新抗原且结构松散的多价肿瘤新抗原疫苗序列的最佳路径，最后，连接子添加模块在所需位置精确添加连接子，旨在形成结构稳定且灵活的完整蛋白序列，同时最大限度地减少连接子的使用，优化整体序列的设计。本发明通过这种创新的方法，生成的多价肿瘤新抗原组合序列不仅使用了更少的连接子，结构简洁，而且在最大程度上减少了非预期新抗原的产生，有效地应对了多价抗原设计的挑战。
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公开(公告)号：CN119464284A
公开(公告)日：2025-02-18
申请号：CN202411371662.X
申请日：2024-09-29
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12N15/113 , A61K31/7105 , A61P35/00
Abstract: 本发明提供了适用于环形RNA的新型IRES序列及其变体，非翻译区序列。提供了包含上述IRES序列、非翻译区序列、蛋白编码序列的环形RNA药物。本发明的环形RNA药物平台具有高效的蛋白翻译能力(特别是在免疫细胞中)，精简的序列长度，对多种蛋白序列的兼容性，基于所述环形RNA平台的药物在动物肿瘤模型中展现出良好的治疗效果。
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公开(公告)号：CN118262793B
公开(公告)日：2025-01-03
申请号：CN202410249253.6
申请日：2024-03-05
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明提供了一种高效选择多价肿瘤新抗原组合的系统，旨在输入多个肿瘤新抗原肽段序列，并从这些序列构成的随机组合肽段池中筛选出具有最优化蛋白序列的组合，该系统包含三个关键模块：库构建模块、最优路径选择模块和连接子添加模块，库构建模块负责生成一个包含输入肽段序列所有可能组合的库，并计算每种组合的潜在效用。最优路径选择模块进一步负责从这些组合中筛选出最佳的蛋白序列组合，确保肽段之间的关联既准确又多样化。该模块通过精确筛选，挑选出能以最少的连接子生成、避免产生非预期新抗原且结构松散的多价肿瘤新抗原疫苗序列的最佳路径，最后，连接子添加模块在所需位置精确添加连接子，旨在形成结构稳定且灵活的完整蛋白序列，同时最大限度地减少连接子的使用，优化整体序列的设计。本发明通过这种创新的方法，生成的多价肿瘤新抗原组合序列不仅使用了更少的连接子，结构简洁，而且在最大程度上减少了非预期新抗原的产生，有效地应对了多价抗原设计的挑战。
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