公开(公告)号：CN101436230A

公开(公告)日：2009-05-20

申请号：CN200810209785.8

申请日：2008-12-25

Applicant: 哈尔滨工程大学

Inventor： 张菁 ,  陈怀友 ,  李艳波 ,  李松 ,  赵明 ,  王立伟 ,  王海玲 ,  于思亮 ,  温乃锋 ,  刘波

IPC: G06F19/00

Abstract: 本发明提供的是一种蛋白质折叠仿真中的模蛇方法。(1)初始状态：是一条直线蛋白质序列；(2)开始折叠时：做波浪运动，用函数sin(t)来表示；(3)折叠后期：做短暂的直线运动，用函数x＝x+t来表示；(4)完成折叠：做盘绕运动，用下面函数表示，x(t)＝(C1cos (ωt)+C2sin(ωt))，其中，C和ω是系数，与蛋白质本身的性质有关。对于未知空间结构的蛋白质，可以通过本发明的拟蛇算法对蛋白质链进行中间体和最终空间结构进行预测，从而减少蛋白质空间结构测定过程中所耗费的人力，物力，同时也可以提供折叠分析供理论研究人员参考。

公开(公告)号：CN101436230B

公开(公告)日：2010-12-01

申请号：CN200810209785.8

申请日：2008-12-25

Applicant: 哈尔滨工程大学

Inventor： 张菁 ,  陈怀友 ,  李艳波 ,  李松 ,  赵明 ,  王立伟 ,  王海玲 ,  于思亮 ,  温乃锋 ,  刘波

IPC: G06F19/00

Abstract: 本发明提供的是一种蛋白质折叠仿真中的模蛇方法。(1)初始状态：是一条直线蛋白质序列；(2)开始折叠时：做波浪运动，用函数sin(t)来表示；(3)折叠后期：做短暂的直线运动，用函数x＝x+t来表示；(4)完成折叠：做盘绕运动，用下面函数表示，x(t)＝(C1cos(ωt)+C2sin(ωt))，其中，C和ω是系数，与蛋白质本身的性质有关。对于未知空间结构的蛋白质，可以通过本发明的拟蛇算法对蛋白质链进行中间体和最终空间结构进行预测，从而减少蛋白质空间结构测定过程中所耗费的人力，物力，同时也可以提供折叠分析供理论研究人员参考。