一种针对高通量基因测序图像的小波去噪方法

    公开(公告)号:CN105046665B

    公开(公告)日:2018-04-24

    申请号:CN201510435812.3

    申请日:2015-07-22

    Inventor: 颜珂 徐勇

    Abstract: 本发明提出了一种基于离散小波变换图像去噪方法,应用于高通量基因测序图像去噪。本发明主要是对基于离散小波变换的BiShrink改进,具体操作是使用离散小波变换对BiShrink阈值算法进行改进。传统的BiShrink算法在计算估计小波系数时考虑当前系数、父子系数的相关性。而本发明是在含有高斯噪声的测序图像中,在每个小波系数的邻域内选择部分小波系数来计算局部阈值,并使用拉普拉斯模型表示当前小波系数与父代小波系数之间的关系,进而得到估计小波系数表达式,用于鲁棒的解决待测序图像的去噪问题。通过对比现有的基于局部阈值小波阈值收缩法花费时间和去噪效果,本发明提出的方法去噪性能更优越,花费时间更短,效率更高。

    一种针对高通量基因测序图像的去噪方法

    公开(公告)号:CN105205788A

    公开(公告)日:2015-12-30

    申请号:CN201510433962.0

    申请日:2015-07-22

    Inventor: 颜珂 徐勇

    Abstract: 本发明提出了一种基于à trous小波阈值去噪方法,应用于高通量基因测序图像去噪。本发明主要是对基于硬阈值的各向同性非抽取离散小波算法的改进,具体操作是使用特定的小波对高通量基因测序的图像进行小波分解,针对每一层小波系数,提出使用l1范数计算全局阈值。通过全局阈值和每一层小波系数构建估计小波系数表达式,最后使用小波重构算法得到去噪后的图像。本发明的方法相对于现有技术中具有去噪性能更好的优点,并且通过几组实验数据对比,证明本发明的合理性和鲁棒性。

    一种针对高通量基因测序图像的小波去噪方法

    公开(公告)号:CN105046665A

    公开(公告)日:2015-11-11

    申请号:CN201510435812.3

    申请日:2015-07-22

    Inventor: 颜珂 徐勇

    Abstract: 本发明提出了一种基于离散小波变换图像去噪方法,应用于高通量基因测序图像去噪。本发明主要是对基于离散小波变换的BiShrink改进,具体操作是使用离散小波变换对BiShrink阈值算法进行改进。传统的BiShrink算法在计算估计小波系数时考虑当前系数、父子系数的相关性。而本发明是在含有高斯噪声的测序图像中,在每个小波系数的邻域内选择部分小波系数来计算局部阈值,并使用拉普拉斯模型表示当前小波系数与父代小波系数之间的关系,进而得到估计小波系数表达式,用于鲁棒的解决待测序图像的去噪问题。通过对比现有的基于局部阈值小波阈值收缩法花费时间和去噪效果,本发明提出的方法去噪性能更优越,花费时间更短,效率更高。

    一种针对高通量基因测序图像的去噪方法

    公开(公告)号:CN105205788B

    公开(公告)日:2018-06-01

    申请号:CN201510433962.0

    申请日:2015-07-22

    Inventor: 颜珂 徐勇

    Abstract: 本发明提出了一种基于à trous小波阈值去噪方法,应用于高通量基因测序图像去噪。本发明主要是对基于硬阈值的各向同性非抽取离散小波算法的改进,具体操作是使用特定的小波对高通量基因测序的图像进行小波分解,针对每一层小波系数,提出使用l1范数计算全局阈值。通过全局阈值和每一层小波系数构建估计小波系数表达式,最后使用小波重构算法得到去噪后的图像。本发明的方法相对于现有技术中具有去噪性能更好的优点,并且通过几组实验数据对比,证明本发明的合理性和鲁棒性。

    针对碱基图像的一种降噪方法

    公开(公告)号:CN104657947B

    公开(公告)日:2017-08-22

    申请号:CN201510064027.1

    申请日:2015-02-06

    Inventor: 颜珂 徐勇

    Abstract: 本发明提供了一种针对碱基图像的降噪方法,该方法基于组合滤波以抑制生物图像中的高斯噪声,包括以下步骤:获取荧光显微镜中碱基图像;首先针对碱基图像中的亮点,使用FWHM算法,求出满足该亮点灰度分布的参数δ;然后通过使用LOG算法,检测出该亮点的边缘像素,保存边缘位置图像;最后使用双边滤波器对图像滤波,双边滤波器不仅能保护边缘像素,而且针对高斯噪声具有很好的降噪效果。使用FWHM算法计算得到的δ用于LOG算法检测以及双边滤波器滤波,与通过使用固定值来计算滤波和检测边缘效果相比,使用FWHM方法得到的结果更好。该方法能有效地去除噪声、保持边缘,在有噪声的情况下具有很好的鲁棒性。

    针对碱基图像的一种降噪方法

    公开(公告)号:CN104657947A

    公开(公告)日:2015-05-27

    申请号:CN201510064027.1

    申请日:2015-02-06

    Inventor: 颜珂 徐勇

    Abstract: 本发明提供了一种针对碱基图像的降噪方法,该方法基于组合滤波以抑制生物图像中的高斯噪声,包括以下步骤:获取荧光显微镜中碱基图像;首先针对碱基图像中的亮点,使用FWHM算法,求出满足该亮点灰度分布的参数δ;然后通过使用LOG算法,检测出该亮点的边缘像素,保存边缘位置图像;最后使用双边滤波器对图像滤波,双边滤波器不仅能保护边缘像素,而且针对高斯噪声具有很好的降噪效果。使用FWHM算法计算得到的δ用于LOG算法检测以及双边滤波器滤波,与通过使用固定值来计算滤波和检测边缘效果相比,使用FWHM方法得到的结果更好。该方法能有效地去除噪声、保持边缘,在有噪声的情况下具有很好的鲁棒性。

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