公开(公告)号：CN111663187A

公开(公告)日：2020-09-15

申请号：CN202010648075.6

申请日：2020-07-07

Applicant: 南昌大学第一附属医院

Inventor： 罗东 ,  陈开森 ,  陈嫱 ,  詹佳欢

IPC: C40B50/06 ,  C40B40/06 ,  C12N15/74 ,  C12N15/65 ,  C12N15/66

Abstract: 本发明公开了一种金黄色葡萄球菌转座子测序文库及构建方法，所述构建方法包括：（一）质粒构建：先构建质粒骨架和转座子，再合成完整pSATn21质粒；（二）质粒转化：将pSATn21质粒转入DC10B修饰后再转入金葡菌Newman标准菌株；（三）诱导转座：将上一步所得菌株经培养基培养、转座和洗脱，获得文库；（四）文库验证：在mmeⅠ酶切位点切割该位点下游一定数量的核苷酸序列，得到一段带有转座子片段及一定数量来自于金葡菌Newman基因组的融合片段，通过加接头PCR富集的方式，进行高通量测序。本发明构建方法随机性更高，转座子随机插入至金黄色葡萄球菌基因组的TA位点中，且无偏嗜性；构建的文库为后期高通量筛选细菌耐药、不同条件下的生存能力等奠定基础。

公开(公告)号：CN116426518A

公开(公告)日：2023-07-14

申请号：CN202310205238.7

申请日：2023-03-06

Applicant: 南昌市高新区人民医院(南昌大学第一附属医院高新医院)

Inventor： 陈开森 ,  夏良华 ,  于圣铭

IPC: C12N15/10 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/689 ,  C12Q1/6869 ,  C12N1/20 ,  C12R1/32

Abstract: 本发明公开了一种高效提取结核分枝杆菌核酸的方法及应用，包括以下步骤：(1)配制液体培养基；(2)液化痰液；(3)菌群培养；(4)与裂解液混合；(5)离心混合液；(6)洗脱核酸；(7)纳米孔测序技术检测核酸。本发明首先将牛初乳、葡萄糖、Middlebrook7H9肉汤基础、椰汁、叶酸、甘油和吐温‑80配制液体培养基，快速培养大量结核分枝杆菌，再将尿素、氯化钾、三羟甲基氨基甲烷盐酸盐、聚乙二醇辛基苯基醚、十六烷基三甲基溴化铵和磷酸钾缓冲液组成裂解液，高效提取结核分枝杆菌核酸，提高结核分枝杆菌核酸提取质量，最后使用纳米孔测序技术检测结核分枝杆菌核酸，缩短检测时间至1天内，并且检出率高，以达到快速鉴定结核分枝杆菌的目的。

公开(公告)号：CN104745676A

公开(公告)日：2015-07-01

申请号：CN201510138699.2

申请日：2015-03-27

Applicant: 南昌大学

Inventor： 陈开森 ,  刘涛

IPC: C12Q1/56 ,  C12Q1/14 ,  C12R1/445

Abstract: 本发明公开了动态比浊法检测血浆凝固酶鉴别金黄色葡萄球菌的方法，其步骤为：步骤一、培养葡萄球菌，并用生理盐水调整浊度，待用；步骤二、收集新鲜的正常人混合血浆，充分混匀后加入反应孔板内，滴加步骤一所得菌液；步骤三、将反应液放入比浊仪上检测，通过观察吸光度的变化而鉴别是否产生了血浆凝固酶，从而确定菌株是呈阳性还是阴性，从而鉴定金黄色葡萄球菌。本发明检测的时限更短、检测的敏感度更高、成本更低。