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公开(公告)号：CN111139286A
公开(公告)日：2020-05-12
申请号：CN201911079580.7
申请日：2019-11-07
Applicant: 南方医科大学南方医院
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6886 , C12N15/10 , C40B50/06
Abstract: 本发明涉及一种BCR高通量测序文库的构建方法，其特征在于：其方法基于对BCR的重链IgG及两条轻链IgL及IgK，各自设计了一套引物集合，能扩增目前已发现的所有IgG，IgL，IgK的不同等位基因，同时在扩增时各自加入一套内参序列，经过后期使用内参的校正，能真实的还原BCR的真实情况而建立的高通量测序文库的构建方法。可实现三套引物集合能完全扩增出目前已知的所有IgG，IgL，IgK包含的等位基因，解决了目前混合引物在扩增时会遗漏部分等位基因缺陷；在PCR扩增时加入了内参序列，后期数据分析根据内参进行校正，能有效的纠正PCR过程中产生的偏好性问题；本发明可满足RNA总量大于100ng的样品建库要求。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110241459A
公开(公告)日：2019-09-17
申请号：CN201910468845.6
申请日：2019-05-31
Applicant: 南方医科大学南方医院
IPC: C40B50/06
Abstract: 本发明涉及一种甄别样品间与独立样品自身交叉反应的免疫组库方法，其特征在于：利用RACE的原理使得RNA在进行逆转录成cDNA的时候进行模板转换，在PCR扩增前进行2次预扩增，第一次预扩增使得原来的模板的5`端带上了UMI，第二次预扩增使得模板的3`端带上了UMI，再以此带有双端UMI的产物作为模板进行PCR扩增，同时使用的上下游引物均设计Barcode进行标记PCR扩增，最终得到的产物经过纯化并连接上测序接头序列得到最终的测序文库，本方法实现了对每一条序列的独立标记，可以解决样品内相似序列在PCR扩增反应时产生的交叉反应问题，对于不同细胞受体来源的样品，在PCR扩增时均能实现只使用一对引物进行PCR扩增，实现等效扩增，解决了因多重引物扩增而产生的引物偏好性问题，解决了多个样品同时进行文库构建时出现的样品间的交叉反应的问题。
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公开(公告)号：CN111139286B
公开(公告)日：2023-11-21
申请号：CN201911079580.7
申请日：2019-11-07
Applicant: 南方医科大学南方医院
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6886 , C12N15/10 , C40B50/06
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公开(公告)号：CN110257476A
公开(公告)日：2019-09-20
申请号：CN201910468844.1
申请日：2019-05-31
Applicant: 南方医科大学南方医院
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及一种甄别样品间交叉反应的免疫组库高通量测序文库的构建方法，其特征在于：以大于10ng的RNA为起始量，利用RACE的原理使得RNA在进行逆转录成cDNA的时候进行模板转换，在所有cDNA的5`端加入一段已知的序列，再以此带有已知序列的产物作为模板，使用双端Barcode引物进行PCR扩增，最终得到的产物经过纯化并连接上测序接头序列得到最终的测序文库，利用此测序文库可以对于不同受体来源的样品，在PCR扩增时均能实现只使用一对引物进行PCR扩增，实现等效扩增，解决了因多重引物扩增而产生的引物偏好性问题，同时在PCR扩增时使用的上下游引物均设计由4-12个不同碱基组成的Barcode进行标记，避免了多个样品同时进行文库构建时出现样品间的交叉反应的问题。
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公开(公告)号：CN110241460A
公开(公告)日：2019-09-17
申请号：CN201910468857.9
申请日：2019-05-31
Applicant: 南方医科大学南方医院
IPC: C40B50/06
Abstract: 本发明涉及一种甄别独立样品自身交叉反应的免疫组库方法，其特征在于：以大于10ng的RNA为起始量，利用RACE的原理使得RNA在进行逆转录成cDNA的时候进行模板转换，在PCR扩增前进行2次预扩增实验，第一次预扩增使用带UMI的上游引物，使得原来的模板的5`端带上了UMI，第二次预扩增使用带UMI的下游引物，使得模板的3`端带上了UMI，再以此带有双端UMI的产物作为模板进行PCR扩增，最终得到的产物经过纯化并连接上测序接头序列得到最终的测序文库，本方法使得每条cDNA的两端都标记上不同的且唯一的UMI序列，在完成PCR扩增后可以把多个样品合并构建一个文库，可以解决样品内相似序列在PCR扩增反应时产生的交叉反应问题，对于不同细胞受体来源的样品，在PCR扩增时均能实现只使用一对引物进行PCR扩增，实现等效扩增，解决了因多重引物扩增而产生的引物偏好性问题。
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公开(公告)号：CN110095611A
公开(公告)日：2019-08-06
申请号：CN201910250624.1
申请日：2019-03-29
Applicant: 南方医科大学南方医院
IPC: G01N33/68
Abstract: 本发明提供一种用于诊断动脉粥样硬化疾病的分子标志物TM4SF19及其应用，包括提供跨膜-4-L6家族蛋白19(即TM4SF19蛋白质)或其肽段作为生物标志物在制备或筛选动脉粥样硬化引起的疾病诊断试剂中的应用，所述诊断试剂用于动脉粥样硬化引起的疾病的体外诊断和/或危险分层。本发明发现通过检测患者组织样品中的TM4SF19蛋白质浓度，可以预测动脉粥样硬化引起的疾病的发生，或对上述疾病进行诊断、危险分层等。
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