公开(公告)号：CN120015108A

公开(公告)日：2025-05-16

申请号：CN202510080280.X

申请日：2025-01-17

Applicant: 南京邮电大学

Inventor： 周国强 ,  李犇

IPC: G16B15/30 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00 ,  G06N3/048 ,  G06N3/0499 ,  G06F18/213 ,  G06F18/25

Abstract: 本发明提供了一种基于双虚拟节点消息传递机制的蛋白质‑配体结合亲和力预测方法，属于计算机辅助药物设计技术以及生物和药物信息学领域；所述方法首先需要准备好蛋白质‑配体复合物的三维结构数据集，并在预处理之后构建为复合物图结构；随后通过本发明提出的双虚拟节点消息传递模块充分学习蛋白质‑配体复合物中的相互作用；经过多层消息传递后，通过求和池化，将最终的复合物特征输入至多层感知机获得亲和力预测值；本发明通过引入两个虚拟节点表示蛋白质与配体的整体特征，使模型能够在每次消息传递时感知全局信息，弥补人工定义阈值造成的偏差，增强模型对复杂相互作用模式的理解和学习能力，提高了对蛋白质‑配体结合亲和力预测的准确性。