公开(公告)号：CN111304217A

公开(公告)日：2020-06-19

申请号：CN202010179836.8

申请日：2020-03-13

Applicant: 南京林业大学 ,  南京农业大学

Inventor： 席梦利 ,  辛昊阳 ,  吴玉峰 ,  张文利 ,  宁仪杭 ,  刘光欣

IPC: C12N15/29 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开一种毛果杨着丝粒特异的LINE型反转录转座子序列及其应用，属于生物信息学和分子细胞遗传学领域。该发明主要包括：通过对毛果杨着丝粒DNA高通量测序数据的生物信息学分析，筛选出一种着丝粒特异的LINE型反转录转座子序列。依据该序列设计引物，以毛果杨基因组DNA为模板，经PCR扩增、切胶回收获得目的片段。通过探针标记、染色体制片、荧光原位杂交验证了该序列位于着丝粒区。本发明提供的着丝粒特异的LINE型反转录转座子序列不仅可以准确标记杨树着丝粒的位置，以构建高质量核型图，也为开展杨树着丝粒的结构、功能及进化研究奠定基础，在杨树分子细胞遗传学及基因组学研究领域具有广阔的应用前景。

公开(公告)号：CN111304217B

公开(公告)日：2020-11-10

申请号：CN202010179836.8

申请日：2020-03-13

Applicant: 南京林业大学 ,  南京农业大学

Inventor： 席梦利 ,  辛昊阳 ,  吴玉峰 ,  张文利 ,  宁仪杭 ,  刘光欣

IPC: C12N15/29 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开一种毛果杨着丝粒特异的LINE型反转录转座子序列及其应用，属于生物信息学和分子细胞遗传学领域。该发明主要包括：通过对毛果杨着丝粒DNA高通量测序数据的生物信息学分析，筛选出一种着丝粒特异的LINE型反转录转座子序列。依据该序列设计引物，以毛果杨基因组DNA为模板，经PCR扩增、切胶回收获得目的片段。通过探针标记、染色体制片、荧光原位杂交验证了该序列位于着丝粒区。本发明提供的着丝粒特异的LINE型反转录转座子序列不仅可以准确标记杨树着丝粒的位置，以构建高质量核型图，也为开展杨树着丝粒的结构、功能及进化研究奠定基础，在杨树分子细胞遗传学及基因组学研究领域具有广阔的应用前景。