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公开(公告)号:CN114752689B
公开(公告)日:2023-03-24
申请号:CN202210484131.6
申请日:2022-05-05
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种检测霓虹脂鲤属下物种存在的环境DNA的方法,属于生物技术检测领域。包括以下步骤:1)待测样品环境DNA的提取;2)以待测样品环境DNA为模板,采用霓虹脂鲤属下物种特异性引物对进行PCR扩增;3)根据电泳结果是否发生特异性的扩增判断待测样品中是否存在霓虹脂鲤属下物种。本发明利用霓虹脂鲤属下物种残留水体中的粪便、皮肤脱落物及尸体等遗迹提取环境DNA样品,结合分子生物学技术,开发出具有特异性且扩增效率高的PCR引物,建立了可针对霓虹脂鲤属下物种的快速,准确的检测鉴定方法。为监测可能发生的外来物种入侵提供了新的技术手段,对于防止霓虹脂鲤属下物种的入侵具有重要意义。
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公开(公告)号:CN114752689A
公开(公告)日:2022-07-15
申请号:CN202210484131.6
申请日:2022-05-05
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种检测霓虹脂鲤属下物种存在的环境DNA的方法,属于生物技术检测领域。包括以下步骤:1)待测样品环境DNA的提取;2)以待测样品环境DNA为模板,采用霓虹脂鲤属下物种特异性引物对进行PCR扩增;3)根据电泳结果是否发生特异性的扩增判断待测样品中是否存在霓虹脂鲤属下物种。本发明利用霓虹脂鲤属下物种残留水体中的粪便、皮肤脱落物及尸体等遗迹提取环境DNA样品,结合分子生物学技术,开发出具有特异性且扩增效率高的PCR引物,建立了可针对霓虹脂鲤属下物种的快速,准确的检测鉴定方法。为监测可能发生的外来物种入侵提供了新的技术手段,对于防止霓虹脂鲤属下物种的入侵具有重要意义。
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公开(公告)号:CN110669846A
公开(公告)日:2020-01-10
申请号:CN201911068399.6
申请日:2019-11-04
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6809
Abstract: 本发明公开了一种丹顶鹤SNP标记及其筛选方法和应用,属于分子生物学技术领域。本发明通过采集10个丹顶鹤的血液样品,提取基因组DNA,利用GBS-seq方法对所述基因组DNA进行GBS文库构建及测序,采用SAMTOOLS软件进行群体SNP的检测,挑取72个适合设计引物的SNP,根据所述SNP序列设计出相应的引物对,采集另外30个丹顶鹤的基因组DNA并应用上述的引物对进行PCR扩增和测序,最后筛选获得33个高质量的公共SNP位点。作为丹顶鹤的分子标记的33个SNP位点,可以在辅助繁殖,遗传多样性研究,基于SNP的关联分析,以及用于资源鉴定与分类等方面进行应用,对丹顶鹤种群管理具有重要应用价值。
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公开(公告)号:CN112522423B
公开(公告)日:2023-07-18
申请号:CN202011482287.8
申请日:2020-12-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了通俗腔蚓微卫星分子标记及其多态性引物和应用,属于生物技术检测领域。本发明利用RAD‑seq高通量测序技术从通俗腔蚓基因组DNA中筛选出12个微卫星位点,分别为Mv01、Mv02、Mv03、Mv04、Mv05、Mv06、Mv07、Mv08、Mv09、Mv10、Mv11、Mv12,其对应的核苷酸序列如SEQ ID No.1‑12所示;并根据微卫星位点两端的侧翼序列设计特异性引物,引物的核苷酸序列如SEQ ID No.13‑36所示,使用所获得引物的扩增结果具有多态性和稳定性,可适用于通俗腔蚓种群遗传多样性检测,个体鉴定以及分子辅助育种领域,为通俗腔蚓的微卫星多态性检测奠定坚实的基础。
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公开(公告)号:CN112831570A
公开(公告)日:2021-05-25
申请号:CN202110173358.4
申请日:2021-02-08
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了黑异纹魮脂鲤微卫星标记位点及其在本属和近源属鱼类通用性应用,属于生物技术检测领域。本发明提供了黑异纹魮脂鲤5个微卫星分子标记位点及其多态性引物以及其在脂鲤科直线脂鲤属和魮脂鲤属中部分物种中的通用性,如核苷酸序列表所示,所获引物的扩增结果具有高度的多态性和稳定性,为脂鲤科魮脂鲤属以黑异纹魮脂鲤为首的五个物种和直线脂鲤属科斯塔氏直线脂鲤的遗传多样性以及种群间的亲缘关系的鉴定提供技术资料,弥补现有技术的不足。
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公开(公告)号:CN112522423A
公开(公告)日:2021-03-19
申请号:CN202011482287.8
申请日:2020-12-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了通俗腔蚓微卫星分子标记及其多态性引物和应用,属于生物技术检测领域。本发明利用RAD‑seq高通量测序技术从通俗腔蚓基因组DNA中筛选出12个微卫星位点,分别为Mv01、Mv02、Mv03、Mv04、Mv05、Mv06、Mv07、Mv08、Mv09、Mv10、Mv11、Mv12,其对应的核苷酸序列如SEQ ID No.1‑12所示;并根据微卫星位点两端的侧翼序列设计特异性引物,引物的核苷酸序列如SEQ ID No.13‑36所示,使用所获得引物的扩增结果具有多态性和稳定性,可适用于通俗腔蚓种群遗传多样性检测,个体鉴定以及分子辅助育种领域,为通俗腔蚓的微卫星多态性检测奠定坚实的基础。
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公开(公告)号:CN110373479B
公开(公告)日:2022-05-24
申请号:CN201910716042.8
申请日:2019-08-02
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了柳莺属鸟类通用微卫星分子标记位点、引物及应用,属于生物技术检测领域。本发明提供了柳莺属鸟类27个通用微卫星分子标记及其多态性引物,如核苷酸序列表所示,所获引物的扩增结果具有高度的多态性和稳定性,为柳莺属鸟类的遗传多样性以及种群间的亲缘关系的鉴定提供技术资料,可应用于柳莺属鸟类种内及种间遗传多样性检测、数量性状遗传图谱、遗传连锁作图、以及家系和个体鉴定等,弥补了现有技术的不足。
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公开(公告)号:CN110669846B
公开(公告)日:2020-11-13
申请号:CN201911068399.6
申请日:2019-11-04
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6809
Abstract: 本发明公开了一种丹顶鹤SNP标记及其筛选方法和应用,属于分子生物学技术领域。本发明通过采集10个丹顶鹤的血液样品,提取基因组DNA,利用GBS‑seq方法对所述基因组DNA进行GBS文库构建及测序,采用SAMTOOLS软件进行群体SNP的检测,挑取72个适合设计引物的SNP,根据所述SNP序列设计出相应的引物对,采集另外30个丹顶鹤的基因组DNA并应用上述的引物对进行PCR扩增和测序,最后筛选获得33个高质量的公共SNP位点。作为丹顶鹤的分子标记的33个SNP位点,可以在辅助繁殖,遗传多样性研究,基于SNP的关联分析,以及用于资源鉴定与分类等方面进行应用,对丹顶鹤种群管理具有重要应用价值。
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