公开(公告)号：CN116246696A

公开(公告)日：2023-06-09

申请号：CN202310319885.0

申请日：2023-03-29

Applicant: 南京师范大学

Inventor： 陈晓健 ,  顾彦慧 ,  刘畅 ,  张先锋 ,  夏浩辉 ,  李杨 ,  李亚飞 ,  王金兰

IPC: G16B15/30 ,  G16B35/20 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00 ,  G06F16/901 ,  G06F16/903

Abstract: 本发明公开了一种基于快速检索的配体对接姿势虚拟筛选方法，包括：对配体构象信息数据进行预处理，建立得到以检索树空间索引结构的索引表；输入已知的活性配体构象，利用检索树空间索引结构来快速检索和筛选与查询构象相似的潜在候选构象，将最相似的top‑k查询结果作为top‑k构象结果；对检索得到的top‑k构象结果进行评估，比较输出top‑k候选构象与天然构象的实际RMSD值，验证筛选结果的准确性，对筛选策略进一步优化。本发明基于配体分子的空间数据，利用三维空间检索树组织数据结构、创建索引，以减少搜索范围，从而能够在海量配体结构数据中快速检索出最佳对接姿势结构，有效提高预测性能。