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公开(公告)号:CN106636197A
公开(公告)日:2017-05-10
申请号:CN201610843834.8
申请日:2016-09-22
Applicant: 南京市妇幼保健院 , 南京大学 , 南京尧顺禹生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种定向敲降斑马鱼基因组中多拷贝基因的方法,包括以下步骤:步骤一:斑马鱼胚胎的制备;步骤二:dCas9‑Eve融合蛋白的表达载体构建;步骤三:进行sgRNA、dCas9‑Eve、Cas9和基因的体外转录,再将体外转录合成的sgRNA、dCas9‑Eve、Cas9mRNA和基因mRNA用RNeasy Mini Kit进行纯化;步骤四:sgRNA的活性鉴定;步骤五:dCas9‑Eve法敲降多拷贝基因znfl1s的表达,用胚胎整体原位杂交法通过检测基因的表达,判定基因表达被敲降的情况。本发明利用dCas9‑Eve的方法,在有效靶向识别基因启动子的sgRNA存在的情况下,可特异敲降基因的转录,避免了在研究基因在胚胎早期发育中受MO毒性或者脱靶导致的非特异性表型的影响,而且Eve抑制转录结构域是斑马鱼来源的,因此dCas9‑Eve可以适用于对任何斑马鱼基因在转录水平的敲降。
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公开(公告)号:CN106636197B
公开(公告)日:2019-09-03
申请号:CN201610843834.8
申请日:2016-09-22
Applicant: 南京市妇幼保健院 , 南京大学 , 南京尧顺禹生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种定向敲降斑马鱼基因组中多拷贝基因的方法,包括以下步骤:步骤一:斑马鱼胚胎的制备;步骤二:dCas9‑Eve融合蛋白的表达载体构建;步骤三:进行sgRNA、dCas9‑Eve、Cas9和基因的体外转录,再将体外转录合成的sgRNA、dCas9‑Eve、Cas9mRNA和基因mRNA用RNeasy Mini Kit进行纯化;步骤四:sgRNA的活性鉴定;步骤五:dCas9‑Eve法敲降多拷贝基因znfl1s的表达,用胚胎整体原位杂交法通过检测基因的表达,判定基因表达被敲降的情况。本发明利用dCas9‑Eve的方法,在有效靶向识别基因启动子的sgRNA存在的情况下,可特异敲降基因的转录,避免了在研究基因在胚胎早期发育中受MO毒性或者脱靶导致的非特异性表型的影响,而且Eve抑制转录结构域是斑马鱼来源的,因此dCas9‑Eve可以适用于对任何斑马鱼基因在转录水平的敲降。
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公开(公告)号:CN109207524A
公开(公告)日:2019-01-15
申请号:CN201710545564.7
申请日:2017-06-29
Applicant: 南京尧顺禹生物科技有限公司
IPC: C12N15/90 , C12N9/22 , C12N15/113 , A01K67/027 , A61K49/00
CPC classification number: C12N15/902 , A01K67/0276 , A01K2207/15 , A01K2217/075 , A01K2227/40 , A01K2267/0362 , A61K49/0008 , C12N9/22 , C12N15/113
Abstract: 本发明涉及基于FTO基因的人类肥胖症斑马鱼模型的建立与应用,具体步骤包括针对斑马鱼fto基因编码关键功能结构域的外显子设计CRISPR序列,筛选确认可有效引导Cas9切割目标基因的活性sgRNA,然后运用有活性的sgRNA,制备fto基因敲除的初建者,待初建者生长至性成熟,令其自由交配,产生F1代;通过对F1个体的基因型鉴定,筛选fto基因敲除的斑马鱼突变体;通过对fto基因纯合突变的分析,确立fto的功能缺失有益于斑马鱼仔鱼的脂肪累积的减少,建立基于fto基因的人类肥胖症的斑马鱼模型,进而可将fto作为标识基因应用于筛选与建立治疗人类肥胖症的新药物与新方法。
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公开(公告)号:CN109207523A
公开(公告)日:2019-01-15
申请号:CN201710545563.2
申请日:2017-06-29
Applicant: 南京尧顺禹生物科技有限公司
IPC: C12N15/90 , C12N15/113 , A01K67/027 , A61K49/00
CPC classification number: C12N15/902 , A01K67/0276 , A01K2207/15 , A01K2217/075 , A01K2227/40 , A01K2267/0362 , A61K49/0008 , C12N15/113
Abstract: 本发明涉及基于UCP1基因的人类肥胖症斑马鱼模型的建立与应用,具体步骤包括针对斑马鱼ucp1基因编码关键功能结构域的外显子设计CRISPR序列,筛选确认可有效引导Cas9切割目标基因的活性sgRNA,然后运用有活性的sgRNA,制备ucp1基因敲除的初建者,待初建者生长至性成熟,令其自由交配,产生F1代;通过对F1个体的基因型鉴定,筛选fto基因敲除的斑马鱼突变体;通过对ucp1基因纯合突变的分析,确立ucp1的功能缺失有益于斑马鱼仔鱼的脂肪累积的减少,建立基于ucp1基因的人类肥胖症的斑马鱼模型,进而将ucp1作为标识基因应用于筛选与建立治疗人类肥胖症的新药物与新方法。
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