方格星虫SSR引物组及其应用和构建方格星虫核心种质的方法

    公开(公告)号:CN118834958A

    公开(公告)日:2024-10-25

    申请号:CN202410908253.2

    申请日:2024-07-08

    申请人: 北部湾大学

    摘要: 本发明涉及分子标记技术领域,特别涉及方格星虫SSR引物组及其应用和构建方格星虫核心种质的方法,本发明利用自行构建的方格星虫SSR引物组对方格星虫的8个群体,333个样本进行遗传分析,并筛选出方格星虫种质的核心种质,该种质能够在分子水平有效的代表333份原种质的遗传多样性,为提高种质资源的利用效率奠定坚实基础。本发明筛选出的SSR引物组具有多态性好,特异性高的特点,利用该引物组进行聚类分析、构建核心种质都能取得良好的效果,是一种准确、高效的SSR分子标记,能为今后方格星虫开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的基因位点和鉴定引物。

    基于施氏獭蛤基因组的InDel标记开发的引物组及其应用

    公开(公告)号:CN118685538A

    公开(公告)日:2024-09-24

    申请号:CN202410991229.X

    申请日:2024-07-23

    申请人: 北部湾大学

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12N15/11

    摘要: 本发明涉及分子标记技术领域,特别涉及基于施氏獭蛤基因组的InDel标记开发的引物组及其应用,本发明基于施氏獭蛤基因组InDel标记开发出12对InDel引物对,使用该InDel标记的施氏獭蛤群体的平均等位基因17.500;平均香农信息指数1.928,高于现有技术;多态信息含量(PIC)的平均值为0.764,11个InDel位点的多态信息含量(PIC)均大于0.5,具有高多态性的特点,能有效的对施氏獭蛤进行遗传分析和聚类分析,能为后期提高对施氏獭蛤种质资源的利用奠定了坚实基础和理论基础。

    一种施氏獭蛤SSR引物组及其应用

    公开(公告)号:CN115976222B

    公开(公告)日:2024-07-16

    申请号:CN202210805622.6

    申请日:2022-07-08

    申请人: 北部湾大学

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12N15/11

    摘要: 本发明涉及分子标记技术领域,特别涉及一种施氏獭蛤SSR引物组及其应用,本发明以施氏獭蛤为材料,利用PacBio测序平台完成施氏獭蛤的全长转录组测序,并利用MISA搜索SSR位点,得到438个SSR位点,根据SSR位点设计出11对施氏獭蛤的SSR分子标记引物,通过验证,该引物的等位基因数目和多态信息指数远高于现有技术开发的施氏獭蛤SSR引物,具有多态性好,特异性高,有效区分参试样本,甚至在亲缘关系较近的几个本地品种中都能对施氏獭蛤进行有效区分的特点,同时,本申请利用该引物组进行聚类分析、绘制DNA指纹图谱都能取得良好的效果,能为今后施氏獭蛤开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的基因位点和鉴定引物。

    一种钝缀锦蛤SSR引物组及其应用

    公开(公告)号:CN115961055A

    公开(公告)日:2023-04-14

    申请号:CN202211578439.3

    申请日:2022-12-09

    申请人: 北部湾大学

    摘要: 本发明涉及分子标记技术领域,特别涉及一种钝缀锦蛤SSR引物组及其应用,本发明以钝缀锦蛤为材料,对钝缀锦蛤的全基因组信息进行测序,并利用MISA搜索SSR位点,分析SSR的分布特征,设计相应的SSR的引物,通过验证,该引物的等位基因数目和多态信息指数远高于现有技术开发的钝缀锦蛤SSR引物,具有多态性好,特异性高,有效区分参试样本的特点,同时,本申请利用该引物组进行聚类分析、绘制DNA指纹图谱都能取得良好的效果,能为今后钝缀锦蛤开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的基因位点和鉴定引物。

    一种方格星虫SSR引物组及其应用
    6.
    发明公开

    公开(公告)号:CN118006791A

    公开(公告)日:2024-05-10

    申请号:CN202410024485.1

    申请日:2024-01-08

    申请人: 北部湾大学

    摘要: 本发明涉及分子标记技术领域,特别涉及一种方格星虫SSR引物组及其应用,本发明以方格星虫为材料,提取方格星虫的DNA经过检测、分析获得微卫星片段,开发筛选出具有较高多态性的微卫星标记,可揭示北部湾沿岸方格星虫种群的遗传多样性,本发明得到相应的SSR引物,找到适合应用于方格星虫聚类分析的SSR引物组,本引物组具有较高的PIC值,利用SSR引物组进行PCR分析并绘制聚类分析图,为今后开展遗传育种、基因定位、物种亲缘关系鉴别和方格星虫遗传资源保护等研究提供新的引物和思路。

    一种钝缀锦蛤SSR引物组及其应用

    公开(公告)号:CN115961055B

    公开(公告)日:2024-05-07

    申请号:CN202211578439.3

    申请日:2022-12-09

    申请人: 北部湾大学

    摘要: 本发明涉及分子标记技术领域,特别涉及一种钝缀锦蛤SSR引物组及其应用,本发明以钝缀锦蛤为材料,对钝缀锦蛤的全基因组信息进行测序,并利用MISA搜索SSR位点,分析SSR的分布特征,设计相应的SSR的引物,通过验证,该引物的等位基因数目和多态信息指数远高于现有技术开发的钝缀锦蛤SSR引物,具有多态性好,特异性高,有效区分参试样本的特点,同时,本申请利用该引物组进行聚类分析、绘制DNA指纹图谱都能取得良好的效果,能为今后钝缀锦蛤开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的基因位点和鉴定引物。

    一种施氏獭蛤SSR引物组及其应用

    公开(公告)号:CN115976222A

    公开(公告)日:2023-04-18

    申请号:CN202210805622.6

    申请日:2022-07-08

    申请人: 北部湾大学

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12N15/11

    摘要: 本发明涉及分子标记技术领域,特别涉及一种施氏獭蛤SSR引物组及其应用,本发明以施氏獭蛤为材料,利用PacBio测序平台完成施氏獭蛤的全长转录组测序,并利用MISA搜索SSR位点,得到438个SSR位点,根据SSR位点设计出11对施氏獭蛤的SSR分子标记引物,通过验证,该引物的等位基因数目和多态信息指数远高于现有技术开发的施氏獭蛤SSR引物,具有多态性好,特异性高,有效区分参试样本,甚至在亲缘关系较近的几个本地品种中都能对施氏獭蛤进行有效区分的特点,同时,本申请利用该引物组进行聚类分析、绘制DNA指纹图谱都能取得良好的效果,能为今后施氏獭蛤开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的基因位点和鉴定引物。

    一种方格星虫活体运输用包装箱

    公开(公告)号:CN218604626U

    公开(公告)日:2023-03-14

    申请号:CN202222902258.3

    申请日:2022-11-01

    申请人: 北部湾大学

    IPC分类号: A01K63/02

    摘要: 本实用新型涉及活体海鲜的保鲜运输领域技术领域。一种方格星虫活体运输用包装箱,包括箱体和箱盖,所述箱体内铺设有细沙层,所述箱体内中部设有用于放置冰块或冰袋的置冰格,所述置冰格的侧壁上设有通风口;所述箱体的侧壁设有若干个透气孔,所述箱体内设有温湿度传感器,所述箱体外设有显示屏,所述显示屏与所述温湿度传感器电性连接;所述箱盖的内表面设有加湿装置和增氧装置。本实用新型的方格星虫活体运输用包装箱,在运输过程中能够为方格星虫提供温湿度适宜、维持供氧的运输环境,提高方格星虫的存活率。