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公开(公告)号：CN116904569B
公开(公告)日：2023-12-15
申请号：CN202311181331.5
申请日：2023-09-13
Applicant: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本申请公开了一种信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品，该方法包括：获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集，其中，每组第一电信号集包括每个采集时刻下的电信号值；针对每组第一电信号集，对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强，得到第二电信号集；基于多组第一电信号集，以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集，确定目标电信号集。以提升对纳米孔测序所采集的信号的后续处理的精确性。
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公开(公告)号：CN116881634A
公开(公告)日：2023-10-13
申请号：CN202311141730.9
申请日：2023-09-06
Applicant: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC: G06F18/10 , G06F18/214 , G06N20/00
Abstract: 本发明公开一种用于清洗纳米孔信号数据的方法、设备和存储介质。本发明从通道维度进行第一步清洗，然后通过信号本身维度进一步清洗，通过两步清洗能够大大提升数据清洗效果，从而实现对于纳米孔信号质量的量化分析。
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公开(公告)号：CN113930406B
公开(公告)日：2022-04-08
申请号：CN202111546554.8
申请日：2021-12-17
Applicant: 北京齐碳科技有限公司
IPC: C12N9/14 , C12N15/55 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种Pif1‑like解旋酶及其应用，具体地经修饰的Pif1‑like解旋酶、包含Pif1‑like解旋酶的构建体，以及其在表征目标多核苷酸或控制目标多核苷酸穿过孔的移动中的应用。本发明还提供了一种表征目标多核苷酸或控制目标多核苷酸穿过孔的移动的方法。本发明所述的Pif1‑like解旋酶可以有效的控制多核苷酸穿过孔的移动。
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公开(公告)号：CN113462764B
公开(公告)日：2021-12-17
申请号：CN202111018113.0
申请日：2021-09-01
Applicant: 北京齐碳科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种用于表征双链靶多核苷酸的类发夹衔接子、构建体和方法。所述类发夹衔接子包含用于分别与所述双链靶多核苷酸的模板链和互补链连接的第一单链和第二单链，所述第一单链与所述第二单链形成至少1个双链核酸区用于在所述模板链通过跨膜孔后使所述互补链靠近所述跨膜孔。还提供包含上述类发夹衔接子的构建体，以及表征双链靶多核苷酸的方法、试剂盒等。本发明的表征方法具有很多优势，比如平衡靶多核苷酸的模板链和互补链的易位速度、提高测序准确率等。
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公开(公告)号：CN113462764A
公开(公告)日：2021-10-01
申请号：CN202111018113.0
申请日：2021-09-01
Applicant: 北京齐碳科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种用于表征双链靶多核苷酸的类发夹衔接子、构建体和方法。所述类发夹衔接子包含用于分别与所述双链靶多核苷酸的模板链和互补链连接的第一单链和第二单链，所述第一单链与所述第二单链形成至少1个双链核酸区用于在所述模板链通过跨膜孔后使所述互补链靠近所述跨膜孔。还提供包含上述类发夹衔接子的构建体，以及表征双链靶多核苷酸的方法、试剂盒等。本发明的表征方法具有很多优势，比如平衡靶多核苷酸的模板链和互补链的易位速度、提高测序准确率等。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117113063B
公开(公告)日：2024-02-02
申请号：CN202311352700.2
申请日：2023-10-19
Applicant: 北京齐碳科技有限公司 , 广州齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC: G06F18/213 , G06N3/044 , G06N3/0455 , G06N3/0464
Abstract: 本发明公开了一种用于纳米孔信号的编解码系统，包括：编码器和解码器，其中的编码器包括：分窗单元、移位单元和至少两个编码单元；分窗单元将纳米孔信号分割为M个信号段后输出至编码单元，编码单元中至少包括：第一自查询权值计算器；第一自查询权值计算器中包括：至少一个第一注意力模块；第一注意力模块对每个信号段分别进行注意力计算，将M个信号段的注意力计算结果组合成一个注意力计算结果作为信号特征输出；每两个相邻的编码单元之间设置有一个移位单元，用于对信号特征按照预设的平移值进行数据循环平移，将平移后的信号特征重新分割为M个信号段后输出至编码单元。应用本发明可以提高编解码的准确率，提高计算速度、降低内存消耗。
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公开(公告)号：CN116904569A
公开(公告)日：2023-10-20
申请号：CN202311181331.5
申请日：2023-09-13
Applicant: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本申请公开了一种信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品，该方法包括：获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集，其中，每组第一电信号集包括每个采集时刻下的电信号值；针对每组第一电信号集，对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强，得到第二电信号集；基于多组第一电信号集，以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集，确定目标电信号集。以提升对纳米孔测序所采集的信号的后续处理的精确性。
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公开(公告)号：CN116884503B
公开(公告)日：2023-12-26
申请号：CN202311146735.0
申请日：2023-09-06
Applicant: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC: G16B40/10 , G16B40/20 , G16B30/00 , G06F18/24 , G06F18/25 , G06N3/0455 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本申请涉及纳米孔测序领域，具体涉及用于对表征聚合物的第一向量化表示序列进行处理的方法和装置、对后验矩阵进行处理的处理方法和装置、计算设备、计算机可读存储介质和计算机程序产品。用于对表征聚合物的第一向量化表示序列进行处理的方法包括：将第一向量化表示序列输入第一机器学习模型，得到第一机器学习模型输出的权重向量，权重向量与第一向量化表示序列的长度相同，并且包括多个预测易位值，每个预测易位值指示聚合物相对于纳米孔测序的观测位点在相应时间步移动了多少个聚合物单元；以及将第一向量化表示序列与权重向量进行整合，得到表征聚合物的第二向量化表示序列。
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公开(公告)号：CN116881634B
公开(公告)日：2023-12-26
申请号：CN202311141730.9
申请日：2023-09-06
Applicant: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC: G06F18/10 , G06F18/214 , G06N20/00
Abstract: 本发明公开一种用于清洗纳米孔信号数据的方法、设备和存储介质。本发明从通道维度进行第一步清洗，然后通过信号本身维度进一步清洗，通过两步清洗能够大大提升数据清洗效果，从而实现对于纳米孔信号质量的量化分析。
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公开(公告)号：CN117113063A
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202311352700.2
申请日：2023-10-19
Applicant: 北京齐碳科技有限公司 , 广州齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC: G06F18/213 , G06N3/044 , G06N3/0455 , G06N3/0464
Abstract: 本发明公开了一种用于纳米孔信号的编码器、解码器、编解码系统和方法，其中的编码器包括：分窗单元、移位单元和至少两个编码单元；分窗单元将纳米孔信号分割为M个信号段后输出至编码单元，编码单元中至少包括：第一自查询权值计算器；第一自查询权值计算器中包括：至少一个第一注意力模块；第一注意力模块对每个信号段分别进行注意力计算，将M个信号段的注意力计算结果组合成一个注意力计算结果作为信号特征输出；每两个相邻的编码单元之间设置有一个移位单元，用于对信号特征按照预设的平移值进行数据循环平移，将平移后的信号特征重新分割为M个信号段后输出至编码单元。应用本发明可以提高编解码的准确率，提高计算速度、降低内存消耗。
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