公开(公告)号：CN114300040A

公开(公告)日：2022-04-08

申请号：CN202111635166.7

申请日：2021-12-29

Applicant: 北京林业大学

Inventor： 张德强 ,  王丹 ,  房媛媛

IPC: G16B15/30 ,  G16B20/00 ,  G16B25/10 ,  G16B40/30 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明涉及分子遗传学技术领域，特别是涉及一种精准鉴定植物蛋白互作的方法。本发明联合利用共表达调控网络分析与酵母双杂交技术，既可以高通量获得与候选基因在相同组织中，具有显著相关性表达水平的候选靶基因，又可以利用酵母双杂交技术验证候选基因和候选靶基因之间存在的互作关系，克服了高通量测序技术造成的假阳性问题，以及反复利用酵母双杂技术验证互作过程耗时和繁琐的问题，通量高、准确性强，对鉴定植物蛋白互作机制提供了一种快速、高效与可靠的技术手段。

公开(公告)号：CN111781343A

公开(公告)日：2020-10-16

申请号：CN202010690993.5

申请日：2020-07-17

Applicant: 北京林业大学

Inventor： 张德强 ,  房媛媛 ,  肖亮 ,  权明洋 ,  王丹 ,  杜庆章

IPC: G01N33/53 ,  C12Q1/6827

Abstract: 本发明提供了一种检测DNA甲基化修饰影响转录因子与DNA序列结合的方法，涉及分子生物学技术领域。本发明所述方法中可排除杂蛋白对结合反应的影响，降低了实验假阳性，还可以快速精准的检测DNA甲基化修饰对转录因子结合的影响。以杨树OM47基因启动子区域DNA甲基化修饰对BPC2转录因子结合的影响为例，OM47基因启动子区域未被DNA甲基化修饰的DNA序列与BPC2蛋白具有明显的结合条带，并随着冷探针竞争浓度的增加逐渐变浅，而被DNA甲基化修饰的启动子序列与BPC2蛋白没有明显的结合条带，证明启动子区域的DNA甲基化修饰会抑制与转录因子蛋白的结合效率。

公开(公告)号：CN111781343B

公开(公告)日：2023-03-21

申请号：CN202010690993.5

申请日：2020-07-17

Applicant: 北京林业大学

Inventor： 张德强 ,  房媛媛 ,  肖亮 ,  权明洋 ,  王丹 ,  杜庆章

IPC: G01N33/53 ,  C12Q1/6827

Abstract: 本发明提供了一种检测DNA甲基化修饰影响转录因子与DNA序列结合的方法，涉及分子生物学技术领域。本发明所述方法中可排除杂蛋白对结合反应的影响，降低了实验假阳性，还可以快速精准的检测DNA甲基化修饰对转录因子结合的影响。以杨树OM47基因启动子区域DNA甲基化修饰对BPC2转录因子结合的影响为例，OM47基因启动子区域未被DNA甲基化修饰的DNA序列与BPC2蛋白具有明显的结合条带，并随着冷探针竞争浓度的增加逐渐变浅，而被DNA甲基化修饰的启动子序列与BPC2蛋白没有明显的结合条带，证明启动子区域的DNA甲基化修饰会抑制与转录因子蛋白的结合效率。