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公开(公告)号：CN104293896A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298870.7
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q2525/101 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明公开了一种SNP位点基因型分型的方法。该方法包括以下步骤：S1，对目标区域的DNA序列进行克隆测序和多重比对，确定待测SNP位点；S2，针对SNP位点设计PCR扩增引物，PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的3'末端对应待测SNP位点，将对应待测SNP位点的3'末端上的核苷酸进行LNA修饰；S3，采用PCR扩增引物对待测样本的DNA进行扩增，并根据扩增产物中目的条带的有无确定待测样本的SNP位点基因型。应用本发明的技术方案，采用锁核酸引物进行PCR扩增以确定SNP位点的基因型，不仅增加了检测结果的精确性和可靠性，而且极大地提高了实验的灵活性，简化了配套条件并显著地降低了实验成本。
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公开(公告)号：CN105331729A
公开(公告)日：2016-02-17
申请号：CN201510869867.5
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6827 , C12Q1/6895 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了一种SNP位点基因型分型的方法。该方法包括以下步骤：S1，对目标区域的DNA序列进行克隆测序和多重比对，确定待测SNP位点；S2，针对SNP位点设计PCR扩增引物，PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的3'末端对应待测SNP位点，将对应待测SNP位点的3'末端上的核苷酸进行LNA修饰；S3，采用PCR扩增引物对待测样本的DNA进行扩增，并根据扩增产物中目的条带的有无确定待测样本的SNP位点基因型。应用本发明的技术方案，采用锁核酸引物进行PCR扩增以确定SNP位点的基因型，不仅增加了检测结果的精确性和可靠性，而且极大地提高了实验的灵活性，简化了配套条件并显著地降低了实验成本。
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公开(公告)号：CN104293896B
公开(公告)日：2016-03-16
申请号：CN201310298870.7
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种SNP位点基因型分型的方法。该方法包括以下步骤：S1，对目标区域的DNA序列进行克隆测序和多重比对，确定待测SNP位点；S2，针对SNP位点设计PCR扩增引物，PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的3'末端对应待测SNP位点，将对应待测SNP位点的3'末端上的核苷酸进行LNA修饰；S3，采用PCR扩增引物对待测样本的DNA进行扩增，并根据扩增产物中目的条带的有无确定待测样本的SNP位点基因型。应用本发明的技术方案，采用锁核酸引物进行PCR扩增以确定SNP位点的基因型，不仅增加了检测结果的精确性和可靠性，而且极大地提高了实验的灵活性，简化了配套条件并显著地降低了实验成本。
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公开(公告)号：CN105331728A
公开(公告)日：2016-02-17
申请号：CN201510869105.5
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q1/6853 , C12Q2531/113 , C12Q2525/113
Abstract: 本发明公开了一种SNP位点基因型分型的方法。该方法包括以下步骤：S1，对目标区域的DNA序列进行克隆测序和多重比对，确定待测SNP位点；S2，针对SNP位点设计PCR扩增引物，PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的3'末端对应待测SNP位点，将对应待测SNP位点的3'末端上的核苷酸进行LNA修饰；S3，采用PCR扩增引物对待测样本的DNA进行扩增，并根据扩增产物中目的条带的有无确定待测样本的SNP位点基因型。应用本发明的技术方案，采用锁核酸引物进行PCR扩增以确定SNP位点的基因型，不仅增加了检测结果的精确性和可靠性，而且极大地提高了实验的灵活性，简化了配套条件并显著地降低了实验成本。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105331729B
公开(公告)日：2019-01-11
申请号：CN201510869867.5
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种SNP位点基因型分型的方法。该方法包括以下步骤：S1，对目标区域的DNA序列进行克隆测序和多重比对，确定待测SNP位点；S2，针对SNP位点设计PCR扩增引物，PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的3'末端对应待测SNP位点，将对应待测SNP位点的3'末端上的核苷酸进行LNA修饰；S3，采用PCR扩增引物对待测样本的DNA进行扩增，并根据扩增产物中目的条带的有无确定待测样本的SNP位点基因型。应用本发明的技术方案，采用锁核酸引物进行PCR扩增以确定SNP位点的基因型，不仅增加了检测结果的精确性和可靠性，而且极大地提高了实验的灵活性，简化了配套条件并显著地降低了实验成本。
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公开(公告)号：CN105331728B
公开(公告)日：2019-01-11
申请号：CN201510869105.5
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6853
Abstract: 本发明公开了一种SNP位点基因型分型的方法。该方法包括以下步骤：S1，对目标区域的DNA序列进行克隆测序和多重比对，确定待测SNP位点；S2，针对SNP位点设计PCR扩增引物，PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的3'末端对应待测SNP位点，将对应待测SNP位点的3'末端上的核苷酸进行LNA修饰；S3，采用PCR扩增引物对待测样本的DNA进行扩增，并根据扩增产物中目的条带的有无确定待测样本的SNP位点基因型。应用本发明的技术方案，采用锁核酸引物进行PCR扩增以确定SNP位点的基因型，不仅增加了检测结果的精确性和可靠性，而且极大地提高了实验的灵活性，简化了配套条件并显著地降低了实验成本。
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公开(公告)号：CN104293894B
公开(公告)日：2016-08-31
申请号：CN201310298853.3
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供了一种树木SNP位点基因型检测方法。该检测方法包括：步骤S1，采用扩增引物对树木的全基因组DNA进行PCR扩增，得到长度不大于500bp的PCR扩增产物，其中扩增引物具有生物素标记；步骤S2，对步骤S1中得到的PCR扩增产物进行单链制备，得到5’端有生物素标记的DNA单链，DNA单链包含多个待测位点；步骤S3，利用测序引物对步骤S2得到的DNA单链进行焦磷酸测序分析，其中序列读取长度为20～50bp，混合酶用量为390～395μl/plate，荧光底物用量为390～395μl/plate，得到分型结果。该检测方法延长了测序长度，一次测序检测多位点；同时节约了1/3试剂用量降低了成本。
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公开(公告)号：CN104293894A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298853.3
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2563/131
Abstract: 本发明提供了一种树木SNP位点基因型检测方法。该检测方法包括：步骤S1.采用扩增引物对树木的全基因组DNA进行PCR扩增，得到长度不大于500bp的PCR扩增产物，其中扩增引物具有生物素标记；步骤S2.对步骤S1中得到的PCR扩增产物进行单链制备，得到5’端有生物素标记的DNA单链，DNA单链包含多个待测位点；步骤S3.利用测序引物对步骤S2得到的DNA单链进行焦磷酸测序分析，其中序列读取长度为20～50bp，混合酶用量为390～395μl/plate，荧光底物用量为390～395μl/plate，得到分型结果。该检测方法延长了测序长度，一次测序检测多位点；同时节约了1/3试剂用量，降低了成本。
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公开(公告)号：CN104293774A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298732.9
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种杨树CesAs基因内与木材品质性状显著关联的功能SSR标记、其应用及试剂盒。其中，该功能SSR标记包括7A-SSR2和7B-SSR1，7A-SSR2位于杨树CesA7-A外显子3区域，为(TGA)n；7B-SSR1位于CesA7-B内含子4区域，为(TTAA)m。本发明确定的这些功能标记位点为早期筛选优异种质，缩短林木育种周期提供了新的技术手段，同时也为改良木材品质性状的分子研究提供遗传学证据，对于提高我国林木遗传育种工程的发展，以及当前林木育种战略实施具有重要的意义。
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