一种HIV-1整合酶突变株对EVG耐药倍数变化值的预测方法

    公开(公告)号:CN105279395A

    公开(公告)日:2016-01-27

    申请号:CN201510685897.0

    申请日:2015-10-20

    Abstract: 一种HIV-1整合酶突变株对EVG耐药倍数变化值的预测方法,属于生物信息学领域。该方法包括以下几个步骤:(1)编码数据集。建立一个主要突变的基因型及其对应的表现型log FC值得数据集;(2)根据突变导致残基侧链理化性质变化是否一致将数据集中的基因型进行了三种不同的整合,三种整合依据分别为体积变化、电荷变化,综合体积电荷变化;(3)聚类分析法除去异常值;(4)将步骤(3)得到的三类数据集用遗传算法筛选得到优秀种群个体;(5)将三类数据集分别建立多元逐步回归模型。得到回归方程,复相关系数等参数;(6)将待预测的数据带入到回归方程,便可得到相对应的预测值。

    一种吸管式蛋白质快速检测器及使用方法

    公开(公告)号:CN103245659B

    公开(公告)日:2016-01-13

    申请号:CN201310148798.X

    申请日:2013-04-25

    Abstract: 一种吸管式蛋白质快速检测器及使用方法,属于生命科学实验技术领域。由依次连接的橡胶吸球、管体、储液池、反应池、吸头、橡胶封组成;其中,橡胶吸球紧密套在管体上,考马斯亮蓝G-250染液注满于储液池中,橡胶封紧密封住吸头的顶端。使用时,拔掉橡胶封,挤压橡胶吸球,将考马斯亮蓝G-250染液挤出储液池直至考马斯亮蓝G-250染液被挤至吸头顶端,将吸头移入待测样品溶液中并缓慢放松橡胶吸球以吸入待测样品溶液;待考马斯亮蓝G-250染液与待测样品溶液充满反应池时,根据混合液的颜色变化对待测样品溶液中是否含有蛋白质进行初步判断,如果混合液的颜色由灰棕色变为蓝色,则待测样品溶液中含有蛋白质,否则不含有蛋白质。

    通用型离心管架
    3.
    发明公开

    公开(公告)号:CN101983774A

    公开(公告)日:2011-03-09

    申请号:CN201010532102.X

    申请日:2010-10-29

    Abstract: 本发明公开了通用型离心管架,由支撑丝(1)、支撑板(2)和基座(3)组成,支撑丝(1)由刚韧富有弹性的尼龙丝或猪鬃制成,支撑丝(1)固定于两块平行的支撑板(2)内侧,呈相对分布,两侧支撑丝(1)的末端留有间隙,支撑板(2)直立固定于基座(3)上。使用时,将不同规格的离心管直立插入支撑丝(1)中,刚韧富有弹性的支撑丝(1)可稳定保持离心管的直立状态,与使用多种离心管架相比,节省了实验空间,给实验操作带来便利。

    一种HIV-1融合抑制剂体外筛选方法

    公开(公告)号:CN101498722B

    公开(公告)日:2013-10-16

    申请号:CN200910079517.3

    申请日:2009-03-06

    Abstract: 本发明公开了一种HIV-1融合抑制剂体外筛选方法,属生物技术领域。该方法是用可吸附组氨酸标签的磁珠对带有组氨酸标签的HIV-1 gp41五螺旋蛋白粗提物于微孔板上进行包被,微孔板设阴性对照3孔,每孔分别加入2μl二甲亚砜,设阳性对照3孔,包被时不加五螺旋蛋白粗提物,其他孔中每孔分别加入2μl不同浓度的待测化合物样品,之后所有孔均分别加入98μl报告基团标记C-螺旋溶液,在15-40℃下孵育10分钟,甩去孔内液体,洗板后用荧光分析仪检测报告基团信号,计算待测样品的抑制率。本发明方法步骤简单、快速便捷且成本低廉。

    可溶性HIV-1整合酶重组蛋白的制备方法

    公开(公告)号:CN103275945A

    公开(公告)日:2013-09-04

    申请号:CN201310188288.5

    申请日:2013-05-20

    Abstract: 可溶性HIV-1整合酶重组蛋白的制备方法,属于生物技术领域。制备方法包括诱导表达、菌体破碎、纯化等步骤,所用表达培养基含有15-35g/L胰蛋白胨,10-20g/L酵母提取物,2-3g/L氯化钠,1g/L葡萄糖,10-15g/L甘油,2.05g/L磷酸氢二钠,1.27g/L磷酸二氢钠,50mg/L硫酸镁,60mg/L卡那霉素,所用裂解缓冲液含有20mM 4-羟乙基哌嗪乙磺酸,1M氯化钠,2mM β-巯基乙醇,0.3mg/ml溶菌酶,5mM咪唑,pH值为9.0。表达培养基可保证宿主菌的正常生长和目的蛋白的高效表达,裂解缓冲液可加强菌体的破碎效果,增加目的蛋白的可溶性,最终提高目的蛋白的产率。

    预装式琼脂糖凝胶电泳上样缓冲液及使用方法

    公开(公告)号:CN103091384B

    公开(公告)日:2015-07-01

    申请号:CN201210581393.0

    申请日:2012-12-27

    Abstract: 预装式琼脂糖凝胶电泳上样缓冲液及使用方法,属于琼脂糖凝胶电泳技术领域。该缓冲液包括数滴滴状浓缩上样缓冲液、塑封、封舌,塑封由低密度聚乙烯塑料对折紧密粘合而成,每滴滴状浓缩上样缓冲液均匀注入密封在塑封折缝处,数滴滴状浓缩上样缓冲液均匀分散地密封在塑封折缝处,在塑封边缘设有封舌。使用时根据计算将核酸样品吸入移液器,调节移液器使其吸入量增大一滴缓冲液的体积,然后吸入一滴缓冲液,达到混合均匀的目的并上样。本发明进行上样,无需反复量取浓缩上样缓冲液,操作简单易学,省时省力。

    可调宽度式快速切胶装置

    公开(公告)号:CN102839113A

    公开(公告)日:2012-12-26

    申请号:CN201210337444.5

    申请日:2012-09-12

    Abstract: 一种可调宽度式快速切胶装置,属于生命科学实验器材领域。其包括外刃、内刃、外刃手柄、内刃手柄、固定箍、调节旋钮、齿轮、齿轮槽组成。使用时,根据待回收DNA条带的宽度,用调节旋钮调整外刃与内刃之间的距离,使之与待回收DNA条带的宽度相匹配;然后将外刃与内刃对准待回收DNA条带,手持手柄垂直切入琼脂糖凝胶中,即可一次性切下含有待回收DNA条带的凝胶。使用本发明的装置进行切胶,操作简单,整个过程仅需数秒钟,可缩短待回收DNA暴露于紫外线中的时间,降低待回收DNA的变异机率。

    一种基于全局交互传递性与特征融合的多层调控网络关键节点识别方法

    公开(公告)号:CN119741979A

    公开(公告)日:2025-04-01

    申请号:CN202411828954.1

    申请日:2024-12-12

    Abstract: 本发明提供了一种基于全局交互传递性与特征融合的多层调控网络关键节点识别方法,属于生物信息学及计算生物学领域,方法包括:通过构建肿瘤的lncRNA‑miRNA‑mRNA‑TF ceRNA调控网络;选择经典网络拓扑属性以及生物属性(表达变异系数(Corr)和表型相关性(Coef))作为节点特征;利用Bayes算法对节点特征进行融合,将每个节点所得贝叶斯值作为该节点的重要性权重,用PageRank算法在全局网络的相互作用下传递,进一步构建多种特征组合的BPR重要性指标;采用RNADisease数据库中与肿瘤相关的节点作为阳性样本验证BPR指标的预测效果;比较单特征指标、多特征指标与最优BPR指标在RF和Bayes中的预测能力;结果表明,最优BPR指标(包含Degree、EPC、BottleNeck和Coef)在关键节点识别中的能力最强。以肺腺癌为例,本发明成功识别了与肺腺癌进展相关的关键节点,展示了其在生物医学研究及临床应用中的潜在重要价值。

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