公开(公告)号：CN111172299B

公开(公告)日：2021-11-05

申请号：CN201811348812.X

申请日：2018-11-13

Applicant: 北京大学

Inventor： 陈兴 ,  孟丽莹 ,  黄蓉冰 ,  郭怡兰

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6886 ,  C07D473/18

Abstract: 本发明提供了一种RNA代谢标记探针、包含其的试剂盒及其应用。该RNA代谢标记探针为鸟嘌呤核苷酸类似物，鸟嘌呤核苷酸类似物是在鸟嘌呤核苷酸的核糖的第2位C上的‑OH被‑N3取代。本申请通过将原来在碱基上进行修饰的方式，转化为在核糖上进行修饰，并采用鸟嘌呤核苷酸进行代谢标记，在鸟嘌呤核苷酸的核糖的第2位的碳上以叠氮基团取代羟基。该探针不仅能够实现原核RNA的代谢标记及在显微成像、新生RNA的提取测序等诸多方面的应用，而且能够实现对真核RNA的代谢标记，因而也能进一步应用于对真核RNA代谢的相关研究中。

公开(公告)号：CN116334195A

公开(公告)日：2023-06-27

申请号：CN202111580808.8

申请日：2021-12-22

Applicant: 北京大学

Inventor： 陈兴 ,  唐麒 ,  刘璐 ,  张旭 ,  郭怡兰 ,  张绍然

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806 ,  C12N5/09 ,  C07D487/04 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种基于光控细胞标记的空间单细胞转录组测序方法，所述方法使用的探针为ONPF‑biotin，包括使用ONPF‑biotin对待测序细胞进行标记；对ONPF‑biotin标记的细胞进行分选与单细胞测序。本发明实现了高效的光控细胞标记和空间单细胞转录组测序，解决了现有的方法在标记效率低、标记位置数量少、背景信号高、依赖遗传学操作等问题，为研究不同生物体系中细胞的空间分布与调控提供了新一代解决方案。

公开(公告)号：CN111172299A

公开(公告)日：2020-05-19

申请号：CN201811348812.X

申请日：2018-11-13

Applicant: 北京大学

Inventor： 陈兴 ,  孟丽莹 ,  黄蓉冰 ,  郭怡兰

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6886 ,  C07D473/18

Abstract: 本发明提供了一种RNA代谢标记探针、包含其的试剂盒及其应用。该RNA代谢标记探针为鸟嘌呤核苷酸类似物，鸟嘌呤核苷酸类似物是在鸟嘌呤核苷酸的核糖的第2位C上的-OH被-N3取代。本申请通过将原来在碱基上进行修饰的方式，转化为在核糖上进行修饰，并采用鸟嘌呤核苷酸进行代谢标记，在鸟嘌呤核苷酸的核糖的第2位的碳上以叠氮基团取代羟基。该探针不仅能够实现原核RNA的代谢标记及在显微成像、新生RNA的提取测序等诸多方面的应用，而且能够实现对真核RNA的代谢标记，因而也能进一步应用于对真核RNA代谢的相关研究中。