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公开(公告)号：CN117802209A
公开(公告)日：2024-04-02
申请号：CN202311170489.2
申请日：2023-09-12
Applicant: 北京大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 一种高灵敏度的检测染色质状态和基因组信息的方法，包括：染色质转座步骤，使用转座酶对一个或以上的细胞或细胞核的染色质进行转座从而获得基因组DNA片段，同时在片段两端加上标签；富集步骤，使用片段筛选或PCR扩增富集长度大于700核苷酸对的长片段DNA；测序步骤，用第三代测序平台对富集获得的长片段DNA进行测序；分析步骤，对测序得到的数据进行分析，同时获得染色质状态和基因组信息。相比现有ATAC‑seq技术所得数据局限于宽松的染色质开放区域(至少宽于数十核苷酸对的区域)信息，本发明通过测序长片段DNA，可在低至单个细胞的样本中同时获取包括杂合单核苷酸多态性、基因组结构、重复序列等基因组信息，以及较狭窄的染色质开放区域信息。
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