公开(公告)号：CN119811471A

公开(公告)日：2025-04-11

申请号：CN202411742626.X

申请日：2024-11-29

Applicant: 北京大学成都前沿交叉生物技术研究院 ,  北京大学

Inventor： 仉迪 ,  林一瀚 ,  李志远

IPC: G16B15/30 ,  G16B20/20

Abstract: 本申请涉及一种RNA序列修饰预测模型的训练方法、预测方法及相关装置。所述方法包括：获取RNA序列的修饰位点测序数据；基于修饰位点测序数据中具有目标化学修饰的位点和不具有目标化学修饰的位点，分别得到长度不同的多种正样本序列和在中心位置添加有不同碱基的多种负样本序列，以此构建多层次分类数据库；将多层次分类数据库中的每个样本序列分别输入待训练的修饰预测模型，得到每个样本序列的修饰位点的预测结果；基于预测结果和每个样本序列的实际情况，对待训练的修饰预测模型的模型参数进行更新，直到得到训练后的修饰预测模型。与现有技术相比，本申请能够对提高模型的训练效率和精度。

公开(公告)号：CN119724339A

公开(公告)日：2025-03-28

申请号：CN202411742605.8

申请日：2024-11-29

Applicant: 北京大学成都前沿交叉生物技术研究院 ,  北京大学

Inventor： 仉迪 ,  林一瀚 ,  李志远

IPC: G16B20/30 ,  G06F18/24 ,  G06F18/214

Abstract: 本申请涉及一种mRNA序列核糖体占有率的预测方法、模型训练方法及相关装置。所述方法包括：获取mRNA序列以及mRNA序列在目标细胞类型中的二级结构；将mRNA序列及其二级结构输入预先训练的预测模型，通过预测模型中的不同编码器分别得到mRNA序列的第一嵌入表示和二级结构的第二嵌入表示，基于多头自注意力机制融合第一嵌入表示和第二嵌入表示，得到融合后的嵌入表示，并基于融合后的嵌入表示进行分类；基于预测模型的分类输出，得到在目标细胞类型中mRNA序列的核糖体占有率的预测结果。与现有技术相比，本申请的预测模型在任意一种细胞类型中进行训练后在其他任何细胞类型上进行核糖体占有率的预测，预测精度高，预测模型可迁移性强。

公开(公告)号：CN119250140A

公开(公告)日：2025-01-03

申请号：CN202411276054.0

申请日：2024-09-12

Applicant: 北京大学

Inventor： 杨玉超 ,  李志远 ,  陶耀宇 ,  朱奕航 ,  蔡磊

IPC: G06N3/065 ,  G06N3/0464 ,  G06F17/16 ,  G06N5/04

Abstract: 本发明提供了一种基于忆阻器存内计算架构的卷积神经网络权重映射及像素级推理仿真的方法，对于任意卷积神经网络输入，使用映射方法将输入的卷积神经网络所有权重参数抽象成若干大小的矩形模型，并将其合理分割后，存入忆阻器阵列群中；使用仿真方法将神经网络推理流程划分为若干周期，并仿真出每个周期工作的忆阻器阵列序号及行列数、网络层的输出像素值、需要缓存及允许释放的像素规模，实现了像素级的网络全流水仿真。本发明适用于任意卷积神经网络，为片上缓存容量设计、忆阻器阵列间特征图流水设计等硬件实现提供重要依据，具有广阔的应用前景。