用于检测细胞内能够与RNA结合的靶分子的方法和试剂

    公开(公告)号:CN114441772B

    公开(公告)日:2023-03-21

    申请号:CN202210110474.6

    申请日:2022-01-29

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开用于检测细胞内能够与RNA结合的靶分子的方法和试剂。本发明基于CRISPR‑Cas9技术进行RNA免疫沉淀检测与RAN结合的靶分子。与传统体外转录RNA进行pulldown的实验方法相比,本发明使用细胞来源的RNA和细胞表达的蛋白,可在更接近细胞生理条件下同时分析RNA‑RNA和/或RNA‑蛋白质等之间的相互作用。另外,与传统RNA免疫沉淀技术相比,本发明具有可双向检测RNA‑蛋白质等相互作用的优势,能够节约时间、降低成本。

    检测乙肝病毒rcDNA和/或cccDNA的寡核苷酸组合物、试剂盒和方法及用途

    公开(公告)号:CN109321679A

    公开(公告)日:2019-02-12

    申请号:CN201811239651.0

    申请日:2018-10-24

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开用于检测乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)松弛环状DNA(relaxed circular DNA,rcDNA)和/或共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA)的寡核苷酸组合物、试剂盒和方法及用途。其中寡核苷酸组合物包括第一寡核苷酸和第二寡核苷酸,或者与第一寡核苷酸的序列互补的寡核苷酸和与第二寡核苷酸的序列互补的寡核苷酸;第一寡核苷酸特异性结合至第一序列的至少一部分连续序列,第二寡核苷酸特异性结合至第二序列的至少一部分连续序列,且两个连续序列之间的距离为30-350nt,第一序列为含有cccDNA或rcDNA的跨缺口区的HBV直接重复(direct repeat,DR)序列的DR2-DR1之间的序列,第二序列为DR1的第五个碱基之后的序列。本发明可以有效检测HBV rcDNA和/或cccDNA的水平,而不受整合HBV DNA的影响。

    用于检测细胞内能够与RNA结合的靶分子的方法和试剂

    公开(公告)号:CN114441772A

    公开(公告)日:2022-05-06

    申请号:CN202210110474.6

    申请日:2022-01-29

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开用于检测细胞内能够与RNA结合的靶分子的方法和试剂。本发明基于CRISPR‑Cas9技术进行RNA免疫沉淀检测与RAN结合的靶分子。与传统体外转录RNA进行pulldown的实验方法相比,本发明使用细胞来源的RNA和细胞表达的蛋白,可在更接近细胞生理条件下同时分析RNA‑RNA和/或RNA‑蛋白质等之间的相互作用。另外,与传统RNA免疫沉淀技术相比,本发明具有可双向检测RNA‑蛋白质等相互作用的优势,能够节约时间、降低成本。

    检测乙肝病毒rcDNA和/或cccDNA的寡核苷酸组合物、试剂盒和方法及用途

    公开(公告)号:CN109321679B

    公开(公告)日:2020-11-13

    申请号:CN201811239651.0

    申请日:2018-10-24

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开用于检测乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)松弛环状DNA(relaxed circular DNA,rcDNA)和/或共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA)的寡核苷酸组合物、试剂盒和方法及用途。其中寡核苷酸组合物包括第一寡核苷酸和第二寡核苷酸,或者与第一寡核苷酸的序列互补的寡核苷酸和与第二寡核苷酸的序列互补的寡核苷酸;第一寡核苷酸特异性结合至第一序列的至少一部分连续序列,第二寡核苷酸特异性结合至第二序列的至少一部分连续序列,且两个连续序列之间的距离为30‑350nt,第一序列为含有cccDNA或rcDNA的跨缺口区的HBV直接重复(direct repeat,DR)序列的DR2‑DR1之间的序列,第二序列为DR1的第五个碱基之后的序列。本发明可以有效检测HBV rcDNA和/或cccDNA的水平,而不受整合HBV DNA的影响。

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