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公开(公告)号:CN118497374A
公开(公告)日:2024-08-16
申请号:CN202310116016.8
申请日:2023-02-14
Applicant: 兰州大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明开发了一种基于高通量测序技术分析微生物群落绝对丰度的方法并予以应用,属于微生物扩增子检测技术领域。本发明使用合成的嵌合DNA作为内标以同时对样品中的微生物群落(包括细菌、真菌和原生生物)进行绝对定量。具体方法如下:合成的嵌合DNA直接添加到环境样品中;提取环境样本的基因组DNA;PCR扩增真菌ITS序列、细菌16S序列和原核生物18S序列,进行高通量测序;高通量测序结果计算扩增子家族的相对丰度和绝对丰度(例如每单位质量样品的原核16S、真核18S和真菌ITS)。本发明以高度复杂的环境样品作为研究对象证明了该方法能够灵敏准确地量化特定群体的绝对丰度。本方法广泛适用于不同来源样品的微生物群落分析,包括来自土壤的环境样品、来自植物组织的样品、来自人类肠道的样品以及来自食物样品的样品。本发明方法操作简单、检测准确、应用广泛,在微生物群落的鉴定分析中具有广阔的市场前景。