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公开(公告)号：CN110951853B
公开(公告)日：2021-03-30
申请号：CN201911264769.3
申请日：2019-12-10
Applicant: 中山大学附属第一医院
IPC: C12Q1/6869 , G16B20/30 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种能精确检测人基因组中DNA病毒的方法，该方法能准确评估双链DNA病毒感染型别及载量的分析方法，并同时准确、灵活的判断整合入人类基因组的双链DNA病毒型别、整合位点及产生的融合序列。本发明的方法可同时检测多种不同的病毒感染；本发明的方法可精细区分同种病毒不同亚型的读段归类，以此判断病毒载量；本发明的方法适用于建库来源不同的读段类型，具有NGS病毒病原学检测的通用性。
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公开(公告)号：CN110951853A
公开(公告)日：2020-04-03
申请号：CN201911264769.3
申请日：2019-12-10
Applicant: 中山大学附属第一医院
IPC: C12Q1/6869 , G16B20/30 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种能精确检测人基因组中DNA病毒的方法，该方法能准确评估双链DNA病毒感染型别及载量的分析方法，并同时准确、灵活的判断整合入人类基因组的双链DNA病毒型别、整合位点及产生的融合序列。本发明的方法可同时检测多种不同的病毒感染；本发明的方法可精细区分同种病毒不同亚型的读段归类，以此判断病毒载量；本发明的方法适用于建库来源不同的读段类型，具有NGS病毒病原学检测的通用性。
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公开(公告)号：CN109055376A
公开(公告)日：2018-12-21
申请号：CN201810937864.4
申请日：2018-08-16
Applicant: 中山大学附属第一医院 , 中山大学
IPC: C12N15/113 , C12N15/90 , C12N9/22 , A61K48/00 , A61K31/7105 , A61P31/20
Abstract: 本发明公开一种用于治疗HPV感染的药物及其应用，用于靶向编辑人乳头瘤病毒E6蛋白mRNA的crRNA的序列如SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2所示；本发明设计的crRNA可用于构建Crispr/Cas13a系统，可用于治疗HPV感染。
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公开(公告)号：CN112331264A
公开(公告)日：2021-02-05
申请号：CN202011311024.0
申请日：2020-11-20
Applicant: 中山大学附属第一医院
Abstract: 本发明涉及一种同源2型CRISPR/Cas基因编辑的构建方法，属于基因编辑技术领域，通过深度分析来自各种环境的宏基因组数据，经过组装短读段序列(100‑300)得到长DNA序列(≥4000bp)，在长DNA序列中挖掘出新的2型同源CRISPR/Cas基因编辑系统的方法，该方法预测的内容包括：效应Cas蛋白、与效应Cas蛋白发挥作用相关的辅助蛋白、与效应Cas蛋白发挥作用相关的辅助序列、效应Cas蛋白发挥作用的关键序列。该构建方法易制作，构建效率高，降低了构建成本且普适性强；构建的同源2型CRISPR/Cas基因编辑系统可用于改造靶向基因组，能精确的进行基因组修饰，实现庞大的基因编辑修饰功能。
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公开(公告)号：CN112114145A
公开(公告)日：2020-12-22
申请号：CN202010992308.4
申请日：2020-09-21
Applicant: 中山大学附属第一医院
IPC: G01N33/574 , G01N33/577 , G01N33/543 , G01N33/535
Abstract: 本发明提供一种检测HPV病毒感染致宫颈癌的试剂盒，包含试剂亚组1、2，所述试剂亚组1、2分别以含检测Spondin 1和p16INK4a水平的试剂作为筛选和诊断HPV病毒感染致宫颈癌的标志物，主要分为捕获抗体、检测抗体、化学发光底物AMPPD、稀释液和洗涤浓缩液，所述检测抗体是将碱性磷酸酯酶加入到PBS，再加入戊二醛，然后分别与检测鼠抗人Spondin 1的单克隆抗体或检测鼠抗人p16INK4a的单克隆抗体混合制成，可检测的样品是来自所述对象的血液、血清、血浆、淋巴、脑脊液、腹水、尿和组织活检物。本发明所提供的试剂盒的宫颈癌诊断方法和试剂盒的灵敏度和特异性均得到显著提高，极大地降低了假阳性率，能够有效用于宫颈癌的早期筛查。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109055376B
公开(公告)日：2020-06-05
申请号：CN201810937864.4
申请日：2018-08-16
Applicant: 中山大学附属第一医院 , 中山大学
IPC: C12N15/113 , C12N15/90 , C12N9/22 , A61K48/00 , A61K31/7105 , A61P31/20
Abstract: 本发明公开一种用于治疗HPV感染的药物及其应用，用于靶向编辑人乳头瘤病毒E6蛋白mRNA的crRNA的序列如SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2所示；本发明设计的crRNA可用于构建Crispr/Cas13a系统，可用于治疗HPV感染。
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公开(公告)号：CN113851186A
公开(公告)日：2021-12-28
申请号：CN202110589533.8
申请日：2021-05-28
Applicant: 中山大学 , 中山大学附属第一医院
Abstract: 本发明涉及一种同源2型CRISPR/Cas基因编辑的构建方法，属于基因编辑技术领域，通过深度分析来自各种环境的宏基因组数据，经过组装短读段序列(100‑300)得到长DNA序列(≥4000bp)，在长DNA序列中挖掘出新的2型同源CRISPR/Cas基因编辑系统的方法，该方法预测的内容包括：效应Cas蛋白、与效应Cas蛋白发挥作用相关的辅助蛋白、与效应Cas蛋白发挥作用相关的辅助序列、效应Cas蛋白发挥作用的关键序列。该构建方法易制作，构建效率高，降低了构建成本且普适性强；构建的同源2型CRISPR/Cas基因编辑系统可用于改造靶向基因组，能精确的进行基因组修饰，实现庞大的基因编辑修饰功能。
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公开(公告)号：CN110117654A
公开(公告)日：2019-08-13
申请号：CN201910380511.3
申请日：2019-05-08
Applicant: 中山大学附属第一医院
IPC: C12Q1/6886 , G01N33/68 , G01N33/574
Abstract: 本发明公开了一种预测HPV阳性患者的宫颈病变发生情况的标志物，所述生物标志物为MYC基因或其所编码的蛋白，其氨基酸序列如SEQ NO.1所示，其中所述生物标志有HPV整合位点。使用本发明的生物标志物，能够辅助诊断人乳头瘤病毒阳性患者的宫颈高级别上皮内瘤变的情况，或者筛出有进展为宫颈癌风险的癌前病变人群从而进行重点监测。利用本发明所述的生物标志物检测人乳头瘤病毒阳性患者高危人群的标志物具有快速、精准、方便、假阳性率低等优点，具有重要的临床诊断意义。
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公开(公告)号：CN109517845A
公开(公告)日：2019-03-26
申请号：CN201811284549.2
申请日：2018-10-30
Applicant: 中山大学附属第一医院
Abstract: 本发明公开了一种CRISPR单碱基修复系统，包括能表达sgRNA和Cas9的真核表达载体，以及作为供体模板的单链寡核苷酸，其中，所述单链寡核苷酸的碱基序列与以需要修复的单碱基两侧第30～60个碱基之间的碱基序列基本一致，区别在于，在所述供体模板上，与需要修复的单碱基相应的碱基为未突变野生型的碱基，以及需要修复的单碱基的一侧发生了无义突变。本发明还公开了CRISPR单碱基修复系统在制备治疗β珠蛋白基因CD17A→T点突变导致的β地中海贫血病的药物中的应用。本发明中将CRISPR/Cas表达质粒和donor二者共同转染到细胞中，在293TT细胞中特异性的诱导β17地中海贫血中基因突变位点的无痕定向改造，对开展基于单基因点突变疾病的基因编辑精准治疗，具有重要的临床应用价值。
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公开(公告)号：CN112111605A
公开(公告)日：2020-12-22
申请号：CN202010992418.0
申请日：2020-09-21
Applicant: 中山大学附属第一医院
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明属于生物检测技术领域，具体涉及一种基于CRISPR‑Cas12a和G四链体‑血红素的HPV的检测试剂盒，包括如下组分：DNA提取液、阳性对照、阴性对照、RPA反应液、PS2.M/Hemin溶液、Cas12a/gRNA复合物溶液和检测溶液。检测HPV时，其操作简单、快捷，扩增的特异性较高，十分适合RNA的快速、及时的检测。
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