Patent search ap:("中国科学院计算机网络信息中心") AND inv:"蔡佳威" Page 1

1.

发明公开
基因序列压缩方法、检索方法及装置审中-实审

公开(公告)号：CN118887997A

公开(公告)日：2024-11-01

申请号：CN202410853044.2

申请日：2024-06-28

Applicant: 中国科学院计算机网络信息中心

Inventor： 路长发 , 蔡佳威 , 沈志宏

IPC: G16B30/00 , G16B50/50

Abstract: 本发明公开了基因序列压缩方法、检索方法及装置，属于生物信息学领域。本发明的基因序列压缩方法通过MapReduce框架实现基于2bit的基因序列压缩，包括解析序列文件、序列化处理和拼接存储。本发明的检索方法包括目标序列读取、查询序列预处理、距离表计算和匹配。本发明的装置部分包括导入、导出、查询和功能拓展模块。本发明采用分布式MapReduce框架和无索引字节流匹配，实现大规模基因数据的高效处理和检索，显著提高了压缩速度和检索效率。

Patent Agency Ranking