一种利用质谱图库鉴定蛋白质及其修饰的方法

    公开(公告)号:CN101871945B

    公开(公告)日:2013-05-08

    申请号:CN201010208640.3

    申请日:2010-06-13

    Abstract: 本发明提供一种谱图数据库的生成方法,包括:选取已解析的实验串联质谱谱图,所述已解析的串联质谱谱图中包括母离子肽序列、电荷、修饰类型和位点在内的信息;从所述已解析的实验串联质谱谱图中去除冗余谱图,得到代表谱;将所述代表谱所对应的母离子肽序列按理论碎裂模式进行划分,得到与所述代表谱相对应的理论谱;合并所述代表谱与所对应的理论谱,得到优化谱;对所述优化谱做谱峰标注,由谱峰标注后的优化谱生成谱图数据库。本发明还提供了一种串联质谱谱图鉴定方法。本发明在将候选谱与待解析串联质谱谱图匹配的过程中,考虑了可能由潜在修饰引入的谱峰质荷比偏移,使得含修饰的碎片离子谱峰得到匹配,达到更好的修饰谱图鉴定效果。

    谱库的生成方法和串联质谱谱图鉴定方法

    公开(公告)号:CN101871945A

    公开(公告)日:2010-10-27

    申请号:CN201010208640.3

    申请日:2010-06-13

    Abstract: 本发明提供一种谱图数据库的生成方法,包括:选取已解析的实验串联质谱谱图,所述已解析的串联质谱谱图中包括母离子肽序列、电荷、修饰类型和位点在内的信息;从所述已解析的实验串联质谱谱图中去除冗余谱图,得到代表谱;将所述代表谱所对应的母离子肽序列按理论碎裂模式进行划分,得到与所述代表谱相对应的理论谱;合并所述代表谱与所对应的理论谱,得到优化谱;对所述优化谱做谱峰标注,由谱峰标注后的优化谱生成谱图数据库。本发明还提供了一种串联质谱谱图鉴定方法。本发明在将候选谱与待解析串联质谱谱图匹配的过程中,考虑了可能由潜在修饰引入的谱峰质荷比偏移,使得含修饰的碎片离子谱峰得到匹配,达到更好的修饰谱图鉴定效果。

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