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公开(公告)号：CN106770605A
公开(公告)日：2017-05-31
申请号：CN201611019740.5
申请日：2016-11-14
Applicant: 中国科学院计算技术研究所
IPC: G01N27/62
CPC classification number: G01N27/62
Abstract: 本发明提供了从头测序方法，其包括将待解析的谱图转化为质谱连接图，统计所述质谱连接图中各条路径的得分，提取路径得分高的前若干条普通路径和修饰路径作为候选肽段，其中，所述普通路径为仅由普通边组的路径，所述修改路径为由普通边和修饰边组成的路径且其中仅包含一条修饰边；以及对于每个候选肽段进行肽谱匹配打分，取肽谱匹配打分最高的候选肽段作为所述谱图对应的肽段。该方法可以支持上千种意外修饰的发现，而且不会对肽段鉴定的速度有较大影响。另外，还可以更细粒度地区分相似肽段序列，改善了肽段鉴定的准确率。
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公开(公告)号：CN104182658B
公开(公告)日：2017-05-03
申请号：CN201410382707.3
申请日：2014-08-06
Applicant: 中国科学院计算技术研究所
Abstract: 本发明提供一种串联质谱谱图鉴定方法，其特征在于，包括下列步骤：1)对于待鉴定谱图数据集中的每张谱图，分别在全局序列库中进行限制性搜索，获得各谱图的匹配肽段；2)根据步骤1)所得各谱图的匹配肽段，构建局部序列库，对于待鉴定谱图数据集的每张谱图，分别在所述局部序列库中进行开放式搜索，获得与一部分谱图相匹配的带修饰的肽段，并获得所带修饰的质量和误差区间；3)对于待鉴定谱图数据集中的每张谱图，根据步骤2)所匹配的修饰的质量和误差区间以及当前待鉴定谱图的质量，设定限制性搜索区间，并在全局序列库中进行搜索，获得最终的匹配结果。本发明能够提高串联质谱谱图鉴定的鉴定率和准确度，并且具有较高的搜索速度。
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公开(公告)号：CN106770605B
公开(公告)日：2019-03-26
申请号：CN201611019740.5
申请日：2016-11-14
Applicant: 中国科学院计算技术研究所
IPC: G01N27/62
Abstract: 本发明提供了从头测序方法，其包括将待解析的谱图转化为质谱连接图，统计所述质谱连接图中各条路径的得分，提取路径得分高的前若干条普通路径和修饰路径作为候选肽段，其中，所述普通路径为仅由普通边组的路径，所述修改路径为由普通边和修饰边组成的路径且其中仅包含一条修饰边；以及对于每个候选肽段进行肽谱匹配打分，取肽谱匹配打分最高的候选肽段作为所述谱图对应的肽段。该方法可以支持上千种意外修饰的发现，而且不会对肽段鉴定的速度有较大影响。另外，还可以更细粒度地区分相似肽段序列，改善了肽段鉴定的准确率。
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公开(公告)号：CN104182658A
公开(公告)日：2014-12-03
申请号：CN201410382707.3
申请日：2014-08-06
Applicant: 中国科学院计算技术研究所
Abstract: 本发明提供一种串联质谱谱图鉴定方法，其特征在于，包括下列步骤：1)对于待鉴定谱图数据集中的每张谱图，分别在全局序列库中进行限制性搜索，获得各谱图的匹配肽段；2)根据步骤1)所得各谱图的匹配肽段，构建局部序列库，对于待鉴定谱图数据集的每张谱图，分别在所述局部序列库中进行开放式搜索，获得与一部分谱图相匹配的带修饰的肽段，并获得所带修饰的质量和误差区间；3)对于待鉴定谱图数据集中的每张谱图，根据步骤2)所匹配的修饰的质量和误差区间以及当前待鉴定谱图的质量，设定限制性搜索区间，并在全局序列库中进行搜索，获得最终的匹配结果。本发明能够提高串联质谱谱图鉴定的鉴定率和准确度，并且具有较高的搜索速度。
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