一种配体-蛋白质相互作用的预测方法及装置

    公开(公告)号:CN113571124B

    公开(公告)日:2024-04-23

    申请号:CN202010356774.3

    申请日:2020-04-29

    Abstract: 本发明公开了一种配体‑蛋白质相互作用的预测方法及装置,包括:对目标蛋白质的一级序列进行处理,获得由特征向量组成的若干蛋白质特征序列;基于目标配体的分子指纹图谱获取目标配体的若干原子特征序列;基于所述若干蛋白质特征序列以及所述若干原子特征序列利用预设的预测模型进行预测,获得所述目标蛋白质和所述目标配体相互作用的概率。本发明实施例中当需要预测某个蛋白质和某个配体能否进行相互作用时,只需要获得该蛋白质的各蛋白质特征序列以及该配体的原子特征序列,通过利用预测模型,就能预测出蛋白中哪些氨基酸片段能和配体中哪些原子进行相互作用,由此能够计算出该蛋白质和该配体相互作用的概率。

    一种用于有机化合物的化学结构和命名双向自动转化的处理方法及装置

    公开(公告)号:CN113919290A

    公开(公告)日:2022-01-11

    申请号:CN202010657382.0

    申请日:2020-07-09

    Abstract: 本发明公开了一种用于有机化合物的化学结构和命名双向自动转化的处理方法及装置,在有机物化学结构文件存储格式为SMILES格式、MOL2格式、SDF格式或PDB格式的情况下,在有机物命名方式为IUPAC规定的有机物命名法命名的情况下,所述方法包括:获取目标有机化合物待转换的化学结构文件;利用预设的化学结构转化工具将非SMILES格式的化学结构文件转成SMILES格式;对SMILES格式进行处理获得目标第一向量;利用预设的目标转换模型对目标第一向量进行转换,获得若干第二向量;基于各第二向量的概率,确定目标第二向量;基于目标第二向量确定与所述目标有机化合物结构对应的命名。本发明的处理方法和装置能够使得化学结构与命名之间的转换能够更加方便、快捷,提高了转换效率。

    一种配体-蛋白质相互作用的预测方法及装置

    公开(公告)号:CN113571124A

    公开(公告)日:2021-10-29

    申请号:CN202010356774.3

    申请日:2020-04-29

    Abstract: 本发明公开了一种配体‑蛋白质相互作用的预测方法及装置,包括:对目标蛋白质的一级序列进行处理,获得由特征向量组成的若干蛋白质特征序列;基于目标配体的分子指纹图谱获取目标配体的若干原子特征序列;基于所述若干蛋白质特征序列以及所述若干原子特征序列利用预设的预测模型进行预测,获得所述目标蛋白质和所述目标配体相互作用的概率。本发明实施例中当需要预测某个蛋白质和某个配体能否进行相互作用时,只需要获得该蛋白质的各蛋白质特征序列以及该配体的原子特征序列,通过利用预测模型,就能预测出蛋白中哪些氨基酸片段能和配体中哪些原子进行相互作用,由此能够计算出该蛋白质和该配体相互作用的概率。

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