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公开(公告)号:CN106381337A
公开(公告)日:2017-02-08
申请号:CN201610952937.8
申请日:2016-10-27
Applicant: 中国林业科学研究院林业新技术研究所
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种通过粪便DNA分析大鸨食源植物的方法。本发明提供方法,包括:1)用带有不同碱基标签的trnL基因扩增引物对分别扩增多个待测大鸨粪便中的trnL基因片段,得到多个添加不同碱基标签序列的待测大鸨粪便trnL基因片段;2)混合所述多个添加不同碱基标签序列的待测大鸨粪便trnL基因片段,得到混合片段,高通量测序所述混合片段,得到多个待测大鸨粪便trnL基因片段测序序列;3)将所述多个待测大鸨粪便trnL基因片段测序序列分别与本地植物叶绿体DNA trnL全序列数据库和公共trnL条形码数据库进行比对,根据测序序列与两种数据库中序列的同源性判断待测大鸨食源植物,并根据序列条数计算大鸨摄食某种植物的百分比;本发明为研究动物的食性偏好和食谱研究提供了技术支撑。
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公开(公告)号:CN106381337B
公开(公告)日:2019-11-19
申请号:CN201610952937.8
申请日:2016-10-27
Applicant: 中国林业科学研究院林业新技术研究所
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种通过粪便DNA分析大鸨食源植物的方法。本发明提供方法,包括:1)用带有不同碱基标签的trnL基因扩增引物对分别扩增多个待测大鸨粪便中的trnL基因片段,得到多个添加不同碱基标签序列的待测大鸨粪便trnL基因片段;2)混合所述多个添加不同碱基标签序列的待测大鸨粪便trnL基因片段,得到混合片段,高通量测序所述混合片段,得到多个待测大鸨粪便trnL基因片段测序序列;3)将所述多个待测大鸨粪便trnL基因片段测序序列分别与本地植物叶绿体DNA trnL全序列数据库和公共trnL条形码数据库进行比对,根据测序序列与两种数据库中序列的同源性判断待测大鸨食源植物,并根据序列条数计算大鸨摄食某种植物的百分比;本发明为研究动物的食性偏好和食谱研究提供了技术支撑。
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