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公开(公告)号：CN110564814B
公开(公告)日：2023-02-17
申请号：CN201811552753.8
申请日：2018-12-19
申请人： 西藏大学 , 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12Q1/6811 , C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种基于棉花SSR分子标记筛选藏紫草的特异性SSR标记方法，其包括以下步骤：（1）提取藏紫草根皮部基因组DNA；（2）以第（1）步提取的基因组DNA为模板，选用特异性SSR引物进行PCR扩增；（3）对扩增产物进行凝胶电泳；（4）对电泳结果进行分析，其中所述特异性引物的碱基序列为：SHIN‑1494F：TAACGGAGATGGGTTTCGAC；SHIN‑1494R：CACAACCGTCCATTTCCTCT。本发明方法重复性好、多态性高、遗传稳定、不受环境条件影响，而且检测结果稳定可靠、快速准确、操作简单方便、成本低廉，有利于大规模的快速检测。
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公开(公告)号：CN108060246B
公开(公告)日：2021-09-07
申请号：CN201711477754.6
申请日：2017-12-29
申请人： 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明属于棉花分子育种技术领域，公开了一种与陆地棉纤维强度相关的单体型及其检测和应用。所述的单体型是以棉花稳定的RIL群体为材料，通过基因组重测序的方法得到。利用本发明所公开的这些单体型，为棉花的分子标记辅助选择育种提供了一个新方法，缩短育种周期，在培育优异棉纤维品种或研究中具有重要意义。
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公开(公告)号：CN108018373B
公开(公告)日：2021-06-15
申请号：CN201711408850.5
申请日：2014-09-26
申请人： 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12Q1/6895
摘要： 本发明公开了一种与棉花黄萎病抗性QTL/主效基因位点qDI‑5‑1、qDI‑5‑2、qDI‑5‑3、qDI‑5‑4、qDI‑5‑5连锁的SSR标记，qDI‑5‑1、qDI‑5‑2、qDI‑5‑3、qDI‑5‑4、qDI‑5‑5都位于染色体C5上。利用本发明与棉花黄萎病抗性主效基因位点连锁的SSR标记进行辅助选择可提高棉花黄萎病抗性育种效率。
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公开(公告)号：CN106048033B
公开(公告)日：2019-12-20
申请号：CN201610509302.0
申请日：2016-06-30
申请人： 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6858
摘要： 一种棉花陆海渐渗系的评价方法，本发明公开了一种对陆海渐渗系进行综合评价的方法，其包括：（1）黄萎病抗性鉴定；（2）陆海渐渗系的分子标记分析；（3）确定分子标记在棉花基因组的物理定位；（4）根据分子标记的物理定位，对导入的抗病染色体片段进行物理定位，并绘制陆海渐渗系的物理图谱。本发明结合黄萎病抗性鉴定和分子标记分析，通过分子标记序列与四倍体陆地棉基因组比对，对陆海渐渗系中携带抗病基因进行定位，为抗病基因的克隆与抗病品种的改良奠定基础。
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公开(公告)号：CN110232952A
公开(公告)日：2019-09-13
申请号：CN201811649699.9
申请日：2018-12-30
申请人： 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明公开了一种批量分析微卫星数据的生物信息学方法。本发明所提供的批量分析微卫星数据的生物信息学方法综合运用了检测微卫星无效等位位点的Cervus、MICRO-CHECKER软件，计算群体遗传结构的STRUCTURE分析和PCoA分析，以及结合Perl脚本语言编程等方法。实验证明，本发明所提供的批量分析微卫星数据的生物信息学方法全面而系统，去除无效等位位点的微卫星数据更加准确，整个批量处理过程只需要在Windows系统中即可完成，操作简单可行，效率高，准确性好。
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公开(公告)号：CN108060247A
公开(公告)日：2018-05-22
申请号：CN201711477791.7
申请日：2017-12-29
申请人： 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明属于棉花分子育种技术领域，公开了一种与陆地棉纤维强度相关的单体型及其检测和应用。所述的单体型是以棉花稳定的RIL群体为材料，通过基因组重测序的方法得到。利用本发明所公开的这些单体型，为棉花的分子标记辅助选择育种提供了一种新方法，缩短育种周期，在培育优异棉纤维品种或研究中具有重要意义。
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公开(公告)号：CN108048594A
公开(公告)日：2018-05-18
申请号：CN201711408847.3
申请日：2014-09-26
申请人： 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12Q1/6895
摘要： 本发明公开了一种与棉花黄萎病抗性QTL/主效基因位点qDI‑5‑1、qDI‑5‑2、qDI‑5‑3、qDI‑5‑4、qDI‑5‑5连锁的SSR标记，qDI‑5‑1、qDI‑5‑2、qDI‑5‑3、qDI‑5‑4、qDI‑5‑5都位于染色体C5上。利用本发明与棉花黄萎病抗性主效基因位点连锁的SSR标记进行辅助选择可提高棉花黄萎病抗性育种效率。
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公开(公告)号：CN108018373A
公开(公告)日：2018-05-11
申请号：CN201711408850.5
申请日：2014-09-26
申请人： 中国农业科学院棉花研究所
IPC分类号： C12Q1/6895
摘要： 本发明公开了一种与棉花黄萎病抗性QTL/主效基因位点qDI‑5‑1、qDI‑5‑2、qDI‑5‑3、qDI‑5‑4、qDI‑5‑5连锁的SSR标记，qDI‑5‑1、qDI‑5‑2、qDI‑5‑3、qDI‑5‑4、qDI‑5‑5都位于染色体C5上。利用本发明与棉花黄萎病抗性主效基因位点连锁的SSR标记进行辅助选择可提高棉花黄萎病抗性育种效率。
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公开(公告)号：CN104313016B
公开(公告)日：2018-01-09
申请号：CN201410506198.0
申请日：2014-09-26
申请人： 中国农业科学院棉花研究所
摘要： 本发明公开了一种与棉花黄萎病抗性QTL/主效基因位点qDI‑5‑1、qDI‑5‑2、qDI‑5‑3、qDI‑5‑4、qDI‑5‑5连锁的SSR标记，qDI‑5‑1、qDI‑5‑2、qDI‑5‑3、qDI‑5‑4、qDI‑5‑5都位于染色体C5上。利用本发明与棉花黄萎病抗性主效基因位点连锁的SSR标记进行辅助选择可提高棉花黄萎病抗性育种效率。
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公开(公告)号：CN107043813A
公开(公告)日：2017-08-15
申请号：CN201710097667.1
申请日：2017-02-22
申请人： 中国农业科学院棉花研究所
CPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
摘要： 陆地棉25号染色体与纤维强度相关的SNP分子标记。本发明属于棉花分子育种技术领域，公开了一种与陆地棉纤维强度相关的SNP分子标记及其检测和应用。所述的SNP分子标记是以棉花稳定的RIL群体为材料，通过基因组重测序的方法得到。利用本发明所公开的这些SNP标记，进行分子标记辅助育种选择，可大大缩短育种周期，提高棉花纤维强度的育种效率。
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