公开(公告)号：CN116949154B

公开(公告)日：2024-05-28

申请号：CN202311091690.1

申请日：2023-08-28

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 汪洋 ,  邵东延 ,  沈建忠 ,  夏兆飞 ,  吕艳丽 ,  黄薇 ,  刘洋 ,  马士珍 ,  陈思雨 ,  杨璐 ,  李宜霏

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/70 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明涉及宏转录组测序和病原检测技术领域。本发明提供了一种非治疗目的的基于宏转录组的病原检测方法，包括如下步骤：使用RNA提取试剂盒对样本进行RNA提取，得到RNA样品；使用KAPAmRNA文库制备试剂盒构建RNA样品的宏转录组文库并测序；去除接头序列和宿主基因组序列，对病原微生物进行识别并计算丰度；对宏转录组进行组装，识别耐药基因丰度和耐药基因数据库，确定病原菌的种类。本发明应用宏转录组方法，将样本中所有RNA作为研究对象，通过对样本进行RNA的提取，可以对样本中微生物进行分析。不仅可以得到微生物种类和RNA病毒的信息，还可以评估微生物活性状态，很好地弥补了现有技术的不足。

公开(公告)号：CN116949154A

公开(公告)日：2023-10-27

申请号：CN202311091690.1

申请日：2023-08-28

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 汪洋 ,  邵东延 ,  沈建忠 ,  夏兆飞 ,  吕艳丽 ,  黄薇 ,  刘洋 ,  马士珍 ,  陈思雨 ,  杨璐 ,  李宜霏

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/70 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明涉及宏转录组测序和病原检测技术领域。本发明提供了一种非治疗目的的基于宏转录组的病原检测方法，包括如下步骤：使用RNA提取试剂盒对样本进行RNA提取，得到RNA样品；使用KAPAmRNA文库制备试剂盒构建RNA样品的宏转录组文库并测序；去除接头序列和宿主基因组序列，对病原微生物进行识别并计算丰度；对宏转录组进行组装，识别耐药基因丰度和耐药基因数据库，确定病原菌的种类。本发明应用宏转录组方法，将样本中所有RNA作为研究对象，通过对样本进行RNA的提取，可以对样本中微生物进行分析。不仅可以得到微生物种类和RNA病毒的信息，还可以评估微生物活性状态，很好地弥补了现有技术的不足。