公开(公告)号：CN106599611B

公开(公告)日：2019-04-30

申请号：CN201611128108.4

申请日：2016-12-09

Applicant: 中南大学

Inventor： 邓磊 ,  曾丞

IPC: G16B20/00

Abstract: 本发明涉及生物信息技术领域，公开了一种蛋白质功能标注方法及系统，以提高蛋白质标注的性能、解决生物实验方法成本高昂和效率低下的问题。本发明方法包括：根据第一级结构邻居和第二级结构邻居评估某一功能在待查询蛋白质中出现的第一可能性；并根据所有的同源序列评估该功能在待查询蛋白质中出现的第二可能性；并将待查询蛋白质的PSSM矩阵输入SVM预测模型得出该功能在待查询蛋白质中出现的第三可能性；以及根据基因共表达分数将其它物种中对应该功能的分布情况转换成目标物种中该功能在待查询蛋白质中出现的第四可能性；然后融合第一、第二、第三及第四可能性以评估该功能在待查询蛋白质中出现的综合可能性。

公开(公告)号：CN106599611A

公开(公告)日：2017-04-26

申请号：CN201611128108.4

申请日：2016-12-09

Applicant: 中南大学

Inventor： 邓磊 ,  曾丞

IPC: G06F19/18

CPC classification number: G06F19/18

Abstract: 本发明涉及生物信息技术领域，公开了一种蛋白质功能标注方法及系统，以提高蛋白质标注的性能、解决生物实验方法成本高昂和效率低下的问题。本发明方法包括：根据第一级结构邻居和第二级结构邻居评估某一功能在待查询蛋白质中出现的第一可能性；并根据所有的同源序列评估该功能在待查询蛋白质中出现的第二可能性；并将待查询蛋白质的PSSM矩阵输入SVM预测模型得出该功能在待查询蛋白质中出现的第三可能性；以及根据基因共表达分数将其它物种中对应该功能的分布情况转换成目标物种中该功能在待查询蛋白质中出现的第四可能性；然后融合第一、第二、第三及第四可能性以评估该功能在待查询蛋白质中出现的综合可能性。