一种面向亚纳米孔微流控生物芯片的待测序蛋白质预处理方法

    公开(公告)号:CN116698541A

    公开(公告)日:2023-09-05

    申请号:CN202310691614.8

    申请日:2023-06-12

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明属于纳米孔蛋白质测序领域,具体公开了一种面向亚纳米孔微流控生物芯片的待测序蛋白质预处理方法;本发明的技术方案具体为:将0.001‑0.1%w/v表面活性剂和0.1‑5mM还原剂组成微量变性剂,与50‑500pM的目标蛋白质混合在50‑500mM氯化钠溶液中,在80‑100℃的条件下加热1‑3h,以上浓度均为终浓度;使用本发明所述的方法对蛋白质进行预处理之后,能够在蛋白质表面包裹上均匀等量的SDS阴离子,这为蛋白质单分子能够以电泳的方式在亚纳米孔中实现跨膜易位创造了有利条件,而使得我们能够利用基于固态纳米孔的微流控生物芯片记录采集变性后的蛋白质单分子跨膜易位事件的离子电流信号,从而为蛋白质的单分子测序创造条件。

    一种新型固态亚纳米孔的制备及其在蛋白质测序中的应用

    公开(公告)号:CN116969411A

    公开(公告)日:2023-10-31

    申请号:CN202310455198.1

    申请日:2023-04-25

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明属于蛋白质测序领域,具体公开了一种新型固态亚纳米孔的制备及其在蛋白质测序中的应用;本发明的技术方案具体为:在5nm厚的纯硅薄膜上简单可靠地加工出直径小于1nm的孔,并通过透射电镜成像与多层图像仿真对比,在原子尺度上三维重建孔的空间结构,再将关键的几何参数代入到有限元多物理场的建模中,模拟孔内的电场分布,计算亚纳米孔的电导率,从而评估这种制备方法在蛋白质单分子测序中的应用潜力与性能。本发明的这种新型纳米孔的感应区深度可低于1nm,在开发具有单点残基特异性(kmer=1)的蛋白质从头测序技术中比其他同类型的纳米孔更具优势,为蛋白质变体的单位点残基特异性检测提供了新的思路。

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